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Enregistrement W4400196816 · doi:10.17918/00003501

Structural basis for autoantibody recognition of phosphatidylserine-[beta]2-glycoprotein I and apoptotic cells

2001· dissertation· en· W4400196816 sur OpenAlexfundno aff
Brian A. Cocca

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiquePhagocytosis and Immune Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University
Mots-clésAutoantibodyPhosphatidylserineApoptosisBETA (programming language)GlycoproteinBasis (linear algebra)ImmunologyComputational biologyChemistryMedicineComputer scienceBiologyMolecular biologyAntibodyBiochemistryMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The work described in this dissertation was undertaken to explore the nature of the autoantibody response in two antibody-mediated autoimmune diseases, systemic lupus erythematosus (SLE) and the antiphospholipid syndrome (APS). Mutant versions of a murine anti-DNA and anti-phospholipid autoantibody, 3H9, were constructed and expressed as recombinant single chain Fv (scFv) in Escherichia coli. Purified scFv were tested for binding to phosphatidylserine and to phosphatidylserine as a complex with [beta]2-glycoprotein I ([beta]2GPI) in ELISA, revealing that the 3H9 heavy (H) chain V gene encodes specificity for these antigens. Moreover, it was determined that higher affinity for phosphatidylserine-[beta]2GPI could be achieved by the introduction of arginine residues into the CDR1, CDR2, and FWR3 of the 3H9 H chain at positions previously shown to be important for DNA binding. Flow cytometric analysis of structurally diverse variants of 3H9 established that the autoantibodies preferentially recognize Jurkat cells in advancing stages of apoptosis as defined by positive binding of annexin V and staining with propidium idodide. Confocal fluorescence microscopy revealed that the scFv initially bind to the cell surface at positions that overlap with the binding of annexin V and that the binding of the scFv and annexin V begin to segregate as the cell undergoes blebbing. The segregation of binding was found to culminate in the exclusive localization of the scFv to surface blebs on the apoptotic cells, with annexin V bound to regions between adjacent blebs. The results of these experiments suggest that, in SLE, B cells that express Ig receptors reactive against phosphatidylserine bind to apoptotic blebs and may have implications for the processing of nuclear antigens and the regulation of immune tolerance to self.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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