MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4400237273 · doi:10.3233/jnd-230021

Phenotype-Genotype Correlation of a Cohort of Patients with Congenital Myopathy: A Single Centre Experience from India

2024· article· en· W4400237273 sur OpenAlexaff
Ganaraja Valakunja Harikrishna, Hansashree Padmanabha, Kiran Polavarapu, Ram Murthy Anjanappa, Veeramani Preethish‐Kumar, Bevinahalli N. Nandeesh, Seena Vengalil, ‬Saraswati Nashi, Dipti Baskar, Aneesha Thomas, Mainak Bardhan, Gautham Arunachal, Deepak Menon, Sai Bhargava Sanka, N. Manjunath, Atchayaram Nalini

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuromuscular Diseases · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiomyopathy and Myosin Studies
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIndian subcontinentMedicineMyopathyGenotypeCohortPhenotypePediatricsGenetic heterogeneityGeneticsCorrelationInternal medicineBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Congenital myopathies (CMs) are a diverse group of inherited muscle disorders with broad genotypic and phenotypic heterogeneity. While the literature on CM is available from European countries, comprehensive data from the Indian subcontinent is lacking. Objectives: This study aims to describe the clinical and histopathological characteristics of a cohort of genetically confirmed CMs from India and attempts to do phenotype-genotype correlation. Methods: A retrospective chart review of genetically confirmed CMs was evaluated between January 2016 and December 2020 at the neuromuscular clinic. The clinical, genetic, and follow-up data were recorded in a pre-structured proforma as per the medical records, and the data was analyzed. Results: A total of 31(M: F = 14 : 17) unrelated patients were included. The median age at onset and duration of illness are 2.0(IQR:1-8) years and 6.0(IQR:3-10) years respectively. Clinical features observed were proximodistal weakness (54.8%), facial weakness (64.5%), and myopathic facies (54.8%), followed by ptosis (33.3%), and ophthalmoplegia (19.4%). Muscle histopathology was available in 38.7% of patients, and centronuclear myopathy was the most common histopathology finding. The pathogenic genetic variants were identified in RYR1 (29.0%), DNM2 (19.4%), SELENON (12.9%), KBTBD13 (9.7%), NEB (6.5%), and MYPN (6.5%) genes. Novel mutations were observed in 30.3% of the cohort. Follow-up details were available in 77.4% of children, and the median duration of follow-up and age at last follow-up was 4.5 (Range 0.5-11) years and 13 (Range 3-35) years, respectively. The majority were ambulant with minimal assistance at the last follow-up. Mortality was noted in 8.3% due to respiratory failure in Centronuclear myopathy 1 and congenital myopathy 3 with rigid spines (SELENON). Conclusion: This study highlights the various phenotypes and patterns of genetic mutations in a cohort of pediatric patients with congenital myopathy from India. Centronuclear myopathy was the most common histological classification and the mutations in RYR1 followed by DNM2 gene were the common pathogenic variants identified. The majority were independent in their activities of daily living during the last follow-up, highlighting the fact that the disease has slow progression irrespective of the genotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,391

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Neuromuscular DiseasesMême sujetCardiomyopathy and Myosin StudiesTravaux en français237 207