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Enregistrement W4400292879 · doi:10.1101/2024.07.03.601814

Molecular control of dormancy transitions throughout the year in the monoecious cork oak

2024· preprint· en· W4400292879 sur OpenAlexaff
Helena Silva, Rómulo Sobral, Ana Teresa Alhinho, Hugo Afonso, Teresa Ribeiro, Patrícia M. A. Silva, Hassan Bousbaa, Leonor Morais–Cecílio, Maria Manuela Ribeiro Costa

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Physiology and Cultivation Studies
Établissements canadiensHealth Sciences North
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCorkPlant reproductive morphologyQuercus suberDormancyBiologyControl (management)BotanyEconomicsGermination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Bud dormancy plays a vital role in flowering regulation and fruit production, being highly regulated by endogenous and environmental cues. Deployment of epigenetic modifications and differential gene expression control bud dormancy/break cycles. Information on how these genetic and epigenetic mechanisms are regulated throughout the year is still scarce for temperate trees, such as Quercus suber . Here, the expression levels of QsCENL and QsDYL1 during different seasonal cycles of bud development suggest that QsCENL may be implicated in the establishment of growth cessation in Q. suber and that QsDYL1 is a good dormancy marker. Moreover, the analysis of the profiles of epigenetic marks and the expression of modifiers, in dormant versus non-dormant bud meristems, indicate that epigenetic regulation is implicated in how bud development progresses in Q. suber . The identification of bud specific mechanisms opens new possibilities to understand how trees respond to challenging environmental signals derived from climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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