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Enregistrement W4400321227 · doi:10.26685/urncst.601

The Implementation of Deep Learning Algorithm with Gaussian Blur Data Preprocessing in Circular RNA Classification and Detection

2024· article· en· W4400321227 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced Sensor and Control Systems
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCircular RNAPreprocessorArtificial intelligenceAlgorithmGaussianPattern recognition (psychology)Computer scienceRNAPhysicsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Circular RNAs (circRNAs) are increasingly recognized as key regulators of gene expression due to their unique closed-loop structure and involvement in various cellular processes. This study investigates the utilization of machine learning algorithms in predicting circRNA-disease associations. Methods: This study proposes a novel deep learning approach leveraging artificial neural networks (ANN) for circRNA classification. The methodology involves data collection from circRNA databases, k-mers counting for feature extraction, Gaussian blur implementation for data smoothing, and ANN-based model training. Results: Evaluation of the trained models based on precision, recall, and f1-score metrics shows an overall accuracy of 0.7511, with an average precision score of 0.7982, recall of 0.7511, and f1-score of 0.7637. Discussion: The results indicate that our ANN-based algorithm effectively detects and classifies circRNA datasets with considerable accuracy. Compared to the algorithm from past research, our algorithm is also shown to have less computational power. Conclusion: Comparative analysis demonstrates improved performance compared to previous algorithms, suggesting its potential for widespread implementation due to reduced computational requirements and simpler implementation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,984
Score d'incertitude au seuil0,590

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,399
Écart entre enseignants0,357 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle