Defects in Glabrous 3 (<scp>GL3</scp>) functionality underlie the absence of trichomes in <i>Brassica napus</i>
Notice bibliographique
Résumé
Previously, expression of the Arabidopsis thaliana GLABRA3 (GL3) induced trichome formation in Brassica napus. GL3 orthologues were examined from glabrous (B. oleracea), semi-glabrous (B. napus), moderately hirsute (B. rapa), and very hirsute (B. villosa) Brassica species. Ectopic expression of BnGL3, BrGL3 alleles, or BvGL3 induced trichome formation in glabrous B. napus with the effect on trichome number commensurate with density in the original accessions. Chimeric GL3 proteins in which the B. napus amino terminal region, which interacts with MYB proteins, or the middle region, which interacts with the WD40 protein TTG1, was exchanged with corresponding regions from A. thaliana were as stimulatory to trichome production as AtGL3. Exchange of the carboxy-terminal region containing a bHLH domain and an ACT domain did not alter the trichome stimulatory activity, although modeling of the ACT domain identified differences that could affect GL3 dimerization. B. napus A- and C-genomes orthologues differed in their abilities to form homo- and heterodimers. Modeling of the amino-terminal region revealed a conserved domain that may represent the MYB factor binding pocket. This region interacted with the MYB factors GL1, CPC, and TRY, as well as with JAZ8, which is involved in jasmonic acid-mediated regulation of MYC-like transcription factors. Protein interaction studies indicated that GL1 interaction with GL3 from B. napus and A. thaliana may underlie the difference in their respective abilities to induce trichome formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».