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Enregistrement W4400430430 · doi:10.3389/fendo.2024.1401120

Addressing chemically-induced obesogenic metabolic disruption: selection of chemicals for in vitro human PPARα, PPARγ transactivation, and adipogenesis test methods

2024· review· en· W4400430430 sur OpenAlexfundno aff
Eren Özçağlı, Barbara Kubíčková, Miriam N. Jacobs

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Endocrinology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHealth CanadaEuropean CommissionU.S. Environmental Protection Agency
Mots-clésAdipogenesisPeroxisome proliferator-activated receptorAdipose tissueComputational biologyBioinformaticsBiologyEndocrinologyReceptorBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Whilst western diet and sedentary lifestyles heavily contribute to the global obesity epidemic, it is likely that chemical exposure may also contribute. A substantial body of literature implicates a variety of suspected environmental chemicals in metabolic disruption and obesogenic mechanisms. Chemically induced obesogenic metabolic disruption is not yet considered in regulatory testing paradigms or regulations, but this is an internationally recognised human health regulatory development need. An early step in the development of relevant regulatory test methods is to derive appropriate minimum chemical selection lists for the target endpoint and its key mechanisms, such that the test method can be suitably optimised and validated. Independently collated and reviewed reference and proficiency chemicals relevant for the regulatory chemical universe that they are intended to serve, assist regulatory test method development and validation, particularly in relation to the OECD Test Guidelines Programme. To address obesogenic mechanisms and modes of action for chemical hazard assessment, key initiating mechanisms include molecular-level Peroxisome Proliferator-Activated Receptor (PPAR) α and γ agonism and the tissue/organ-level key event of perturbation of the adipogenesis process that may lead to excess white adipose tissue. Here we present a critical literature review, analysis and evaluation of chemicals suitable for the development, optimisation and validation of human PPARα and PPARγ agonism and human white adipose tissue adipogenesis test methods. The chemical lists have been derived with consideration of essential criteria needed for understanding the strengths and limitations of the test methods. With a weight of evidence approach, this has been combined with practical and applied aspects required for the integration and combination of relevant candidate test methods into test batteries, as part of an Integrated Approach to Testing and Assessment for metabolic disruption. The proposed proficiency and reference chemical list includes a long list of negatives and positives (20 chemicals for PPARα, 21 for PPARγ, and 11 for adipogenesis) from which a (pre-)validation proficiency chemicals list has been derived.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,061

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0070,004
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,395
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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