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Enregistrement W4400475444 · doi:10.11648/j.acm.20241304.11

Exploring Hidden Markov Models in the Context of Genetic Disorders, and Related Conditions: A Systematic Review

2024· review· en· W4400475444 sur OpenAlexaff
Mouhamadou Djima Baranon, Patrick Weke, Judicaël Alladatin, Boni Maxime Ale, Amos Kipkorir Langat

Notice bibliographique

RevueApplied and Computational Mathematics · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesAfrican Union
Mots-clésScope (computer science)Context (archaeology)Variety (cybernetics)Hidden Markov modelRepresentation (politics)Data scienceScale (ratio)Computer scienceBiologyGeographyArtificial intelligencePolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The application of Hidden Markov Models (HMMs) in the study of genetic and neurological disorders has shown significant potential in advancing our understanding and treatment of these conditions. This review assesses 77 papers selected from a pool of 1,105 records to evaluate the use of HMMs in disease research. After the exclusion of duplicate and irrelevant records, the papers were analyzed for their focus on HMM applications and regional representation. A notable deficiency was identified in research across regions such as Africa, South America, and Oceania, emphasizing the need for more diverse and inclusive studies in these areas. Additionally, many studies did not adequately address the role of genetic mutations in the onset and progression of these diseases, revealing a critical research gap that warrants further investigation. Future research efforts should prioritize the examination of mutations to deepen our understanding of how these changes impact the development and progression of genetic and neurological disorders. By addressing these gaps, the scientific community can facilitate the development of more effective and personalized treatments, ultimately enhancing health outcomes on a global scale. Overall, this review highlights the importance of HMMs in this area of research and underscores the necessity of broadening the scope of future studies to include a wider variety of geographical regions and a more comprehensive investigation of genetic mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,022
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,022
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0070,007
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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