Abundance, diversity and evolution of tyrosinase enzymes involved in the adhesive systems of mussels and tubeworms
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The blue mussel ( Mytilus edulis ) and the honeycomb tubeworm ( Sabellaria alveolata ) have evolved similar adhesive systems to cope with the hydrodynamic conditions of the intertidal environment where they live. Both organisms can establish a permanent adhesion through the secretion of adhesive proteins rich in DOPA (3,4-dihydroxyphenylalanine), a post-translationally modified amino acid playing essential roles in interfacial adhesion and bulk cohesion. DOPA is produced by the hydroxylation of tyrosine residues by tyrosinase enzymes, which can also in some cases oxidise it further into dopaquinone Compared to the detailed knowledge available on mussel and tubeworm adhesive proteins, little information exists about the tyrosinases involved in their adhesive systems. By combining different molecular analyses, a catalogue of tyrosinase candidates potentially involved in the adhesive systems of M. edulis and S. alveolata was identified. Some of these candidates were shown to be expressed in the adhesive glands by in situ hybridization, with a high gland-specificity in mussels but not in tubeworms. The diversity of tyrosinases highlighted in the two species suggests the coexistence of different functions (monophenol monooxygenase or catechol oxidase activity) or different substrate specificities. However, the exact role of the different enzymes needs to be further investigated. Phylogenetic analyses support the hypothesis of independent expansions and parallel evolution of tyrosinases involved in adhesive protein maturation in both lineages, supporting the convergent evolution of their DOPA-based adhesion.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».