Leave no stone unturned: Exploring the metaproteome of beerstone for the identification of archaeological beer production
Notice bibliographique
Résumé
In archaeological contexts, identifying processes of beer production and consumption has contributed to our understanding of agriculture, labor mobilization, economic surplus, feasting, gender dynamics, social structure, tribute, community, identity and politics. Nevertheless, in the absence of pictorial representations and characteristic objects, beer brewing is difficult to identify in the archaeological record, and molecular methods are often limited by constraints of preservation and specificity. A potential target for studies of ancient beer production are residues formed during brewing activity, including beerstone, a calcium oxalate residue. Here, we apply shotgun proteomics analyses to a sample of modern beerstone to explore this residue's capacity as a marker for beer in archaeological contexts. The beerstone proteome was compared to the protein profiles of ungerminated and germinated barley to identify key proteins indicative of malted grains which may be encased by the residue. Proteins matching to barley grain (Hordeum vulgare) and Baker's/Brewer's yeast (Saccharomyces cerevisiae) were successfully identified in the beerstone. In particular, we identified hordeins, lipid transfer proteins, trypsin/α-amylase inhibitors, and protein Z, which are barley proteins abundant in proteomic characterisations of beer. In comparison to ungerminated and germinated barley grains, we find that beerstone preserves only a subset of the barley proteome, with the residue being more reflective of the final brewing product than of earlier brewing steps such as malting. Overall, we demonstrate that beerstone has potential to entrap and preserve proteins reflective of the beer-making process and identify proteins that we might anticipate in future archaeological analyses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,003 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».