CLEC18A interacts with sulfated GAGs and controls clear cell renal cell carcinoma progression
Notice bibliographique
Résumé
Abstract C-type lectins are a large family of proteins with essential functions in both health and disease. In cancer, some C-type lectins have been found to both promote and inhibit tumor growth, but many of the C-type lectins still remain uncharacterised in a tumor context. Therefore, there is growing interst in further elucidating the mechanisms with which C-type lectins control tumor growth. Here, we report a key role of the CLEC18 family of C-type lectins in the progression of clear cell renal cell carcinoma (ccRCC). The CLEC18 family is conserved across the entire Chordata phylum with recent gene duplication events in humans. We found that CLEC18A is exclusively expressed in the proximal tubule of the kidney and the medial habenula of the brain. We further identified sulfated glycosaminoglycans (GAGs) of proteoglycans as the main CLEC18A ligand, making them unique among C-type lectins. In ccRCC patients, high expression of the CLEC18 family lectins in the tumor are associated with improved survival. In mouse models of ccRCC, deletion of the mouse ortholog Clec18a resulted in enhanced tumor growth. Our results establishes CLEC18A as a novel and critical regulators of ccRCC tumor growth and highlights the potential benefit of modulating CLEC18 expression in the renal tumor microenvironment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».