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Enregistrement W4400588973 · doi:10.1038/s41590-024-01897-8

Specific CD4+ T cell phenotypes associate with bacterial control in people who ‘resist’ infection with Mycobacterium tuberculosis

2024· article· en· W4400588973 sur OpenAlexaff
Meng Sun, Jolie M. Phan, Nathan S. Kieswetter, Huang Huang, Krystle K. Q. Yu, Malisa T. Smith, Yiran E. Liu, Chuanqi Wang, Sanjana Gupta, Gerlinde Obermoser, Holden T. Maecker, Akshaya Krishnan, Sundari Suresh, Neha Gupta, Mary Rieck, Péter Ács, Mustafa Ghanizada, Shin‐Heng Chiou, Purvesh Khatri, W. Henry Boom, Thomas R. Hawn, Catherine M. Stein, Harriet Mayanja‐Kizza, Mark M. Davis, Chetan Seshadri

Notice bibliographique

RevueNature Immunology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésMycobacterium tuberculosisPhenotypeTuberculosisBiologyMicrobiologyImmunologyVirologyGeneticsMedicineGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A subset of individuals exposed to Mycobacterium tuberculosis ( Mtb ) that we refer to as ‘resisters’ (RSTR) show evidence of IFN-γ − T cell responses to Mtb -specific antigens despite serially negative results on clinical testing. Here we found that Mtb -specific T cells in RSTR were clonally expanded, confirming the priming of adaptive immune responses following Mtb exposure. RSTR CD4 + T cells showed enrichment of T H 17 and regulatory T cell-like functional programs compared to Mtb -specific T cells from individuals with latent Mtb infection. Using public datasets, we showed that these T H 17 cell-like functional programs were associated with lack of progression to active tuberculosis among South African adolescents with latent Mtb infection and with bacterial control in nonhuman primates. Our findings suggested that RSTR may successfully control Mtb following exposure and immune priming and established a set of T cell biomarkers to facilitate further study of this clinical phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,414
Score d'incertitude au seuil0,959

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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