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Enregistrement W4400615168 · doi:10.1002/edn3.586

Detection differences between eDNA and mid‐water trawls are driven by fish biomass and habitat preferences

2024· article· en· W4400615168 sur OpenAlex
Tessa Rehill, Ben Millard‐Martin, Matt Lemay, Kate Sheridan, Anya Mueller, Evan Morien, Rute B. G. Clemente‐Carvalho, Brian P. V. Hunt, Jennifer M. Sunday

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueEnvironmental DNA · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans CanadaTula FoundationMcGill University
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésHabitatFish <Actinopterygii>Biomass (ecology)FisheryEnvironmental scienceFish habitatBiologyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Marine scientific trawl surveys are commonly used to assess the distribution and population size of fisheries‐related species, yet the method is effort‐intensive and can be environmentally destructive. Sequencing environmental DNA (eDNA) from water samples can reveal the presence of organisms in a community without capturing them; however, we expect the detectability of taxa to differ between eDNA and trawl surveys, and understanding how species traits and population variables contribute to detection differences can help calibrate our expectations from each form of sampling. Here, we coupled eDNA metabarcoding and capture trawl surveys in British Columbia, Canada, to examine species traits that explain recurrent differences in detectability between the two methods, including habitat, body size, and biomass. At the regional scale, 17 of 23 fish species (74%) captured by the trawl were detected by eDNA metabarcoding, and 39 additional species were detected by eDNA sampling only. We found that eDNA metabarcoding disproportionately detected trawl‐caught species with greater local biomass (i.e., greater biomass in the adjacent trawl). Fish detected only in eDNA had a greater range of body lengths and a broader range of habitat preferences outside the trawls' target size and sampling areas. Our results suggest that with our level of sampling, eDNA metabarcoding can adequately recapitulate detection of fish communities detected by trawl surveys, but with a bias toward fish of high population biomass and greater inclusion of fish from outside the trawled area.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle