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Enregistrement W4400644676 · doi:10.1101/2024.07.09.602748

Directed fMRI-based Functional Connectivity Estimation using Physics-Informed Neural Networks

2024· preprint· en· W4400644676 sur OpenAlexaff
Roberto C. Sotero, José M. Sánchez‐Bornot

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensHotchkiss Brain InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesEngineering and Physical Sciences Research Council
Mots-clésNeurotypicalComputer scienceArtificial neural networkFunctional magnetic resonance imagingArtificial intelligenceFunctional connectivityMachine learningAutism spectrum disorderScalabilityAutismNeurosciencePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Estimating directed functional connectivity (dFC) within the brain is crucial for comprehending neural interactions. However, conventional methodologies encounter constraints in accuracy, scalability, and interpretation. The method presented here harnesses Physics-Informed Neural Networks (PINNs) to amalgamate the governing physical principles of brain dynamics, thereby improving dFC estimation from resting-state functional magnetic resonance imaging (rsfMRI) data. In particular, during the training phase, we derive the input weights from a long-short term memory (LSTM) network, which, within our framework, represent the influence of all other brain areas on the specific region under consideration. These input weights are then integrated into the nonlinear differential equation that models the rsfMRI time series within the specific brain area. Through the training of the PINN model, we simultaneously estimate, for each brain area, the biophysical parameters of the model, including the dFC parameters from all the remaining areas. We applied this methodology to both autism spectrum disorder (ASD) and neurotypical data, revealing significant sex-specific differences in connectivity patterns. These findings underscore the potential of PINNs in advancing our understanding of neural dynamics and emphasize the significance of directionality in brain connectivity research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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