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Enregistrement W4400653190 · doi:10.1094/phytofr-05-24-0056-r

A Molecular Method to Assess Viability of <i>Phytophthora</i> in Infected Wood Following Phytosanitary Heat Treatment

2024· article· en· W4400653190 sur OpenAlex
Isabel Leal, Nicolas Feau, Adnan Uzunovic, B. Foord, Richard C. Hamelin

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevuePhytoFrontiers™ · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaNatural Resources Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhytophthoraBiologyMicrobiologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

International trade in wood products is an important component of the global economy. However, wood and wood products may have pests associated with them that could be introduced into importing countries, posing phytosanitary risks and leading to the implementation of regulatory restrictions that affect wood trade. The application of heat to kill wood-associated pests has been a successful phytosanitary method to reduce their spread. To evaluate the efficacy of wood heat treatment to kill fungal and fungus-like pathogens, the method of choice has been to grow organisms in cultures for subsequent identification. However, some plant pathogens can be difficult or impossible to grow in axenic cultures, and a molecular method can still be useful for assessing pathogen viability after heat treatment. RNA is a single-stranded molecule that is responsible for the transcription of genes. Since it becomes rapidly unstable after cell death, it provides a measure of viability. We therefore designed and tested RNA-based molecular diagnostic assays targeting essential genes and assessed their presence after heat treatment in wood colonized by four Phytophthora species of phytosanitary concern ( P. × multiformis, P. cinnamomi, P. lateralis, and P. ramorum) through reverse transcription and real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR). Our assays differentiate between genomic and mRNA as the TaqMan probes span exon–intron junctions. We validated these RT-qPCR assays to assess heat treatment efficacy of Phytophthora-inoculated wood. These assays can be very useful tools to assess the effectiveness of current and emerging phytosanitary wood treatments. [Formula: see text] Copyright © 2024 His Majesty the King in Right of Canada, as represented by the Minister of Natural Resources Canada. This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,384
Score d'incertitude au seuil0,341

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle