Proteome-wide Mendelian randomization study implicates inflammaging biomarkers in retinal vasculature, cardiometabolic diseases and longevity
Notice bibliographique
Résumé
With the increasing proportion of elderly individuals, improving understanding of the biological mechanisms involved in healthy aging is of utmost importance. Retinal vascular complexity obtained from retinal fundus photographs, and evaluated as fractal dimension (ie, Df), a measure of the geometric pattern of the retinal vasculature, has recently emerged as a valuable indicator of diseases and aging processes. The purpose of our study was to elucidate possible mechanisms underlying those relationships. By integrating retinal Df with genomic and plasma proteome biomarkers, we uncovered novel pathways involved in determining Df and its links with cardiometabolic diseases and longevity. First, we performed a genome wide association study (GWAS) of retinal vascular Df by meta-analysing signals from 74,434 participants from three large epidemiological cohorts, the Canadian Longitudinal Study of Aging (CLSA), the Genetics of Diabetes Audit and Research in Tayside Scotland (GoDARTS), and the UK Biobank (UKBB). We replicated four known loci associated with Df, and identified one novel locus within or near DAAM1, as well as found seven suggestive associations within or near CSNK1A1L, MAST4, HIVEP1, LOC283038, FNDC3A, SP100, and SUGP1 genes. GWAS summary statistics confirmed a negative correlation between Df and cardiovascular disease, stroke, and inflammation, but a positive correlation with longevity. Next, employing Mendelian randomization which combined genetic determinants of Df, and cis-protein Quantitative Trait Loci from 1,159 circulating proteins from the Prospective Urban and Rural Epidemiological (PURE) cohort (n=12,066), we identified eight causal mediators for Df, namely IgG Fc receptorIIb, BST1, LILRB2, IL16, MMP12, PON2, ALPP, and PDL2. Notably, MMP12 and IgG Fc receptorIIb have been suggested to connect Df to cardiometabolic outcomes (i.e., coronary artery disease, stroke, peripheral artery disease, and type 2 diabetes) and longevity, respectively. Pathway enrichment analyses highlighted the role of IgG Fc receptorIIb in immune and inflammatory responses to aging processes, referred to as inflammaging. This multi-pronged approach unveils IgG Fc recIIb and MMP12 as key mediators in immune and inflammation pathways, linking lower Df to a higher risk of cardiometabolic diseases and a shorter lifespan. Therefore, retinal Df may be a convenient way to estimate inflammaging, such that lower retinal Df, may indicate a higher inflammaging status. Targeting MMP12 and IgG Fc ReceptorIIb may promote healthy aging and mitigating the occurrence of cardiometabolic diseases in the elderly population.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».