Circumpolar population structure, diversity and recent evolutionary history of the bearded seal in relation to past and present icescapes
Notice bibliographique
Résumé
The Arctic environment plays a critical role in the global climate system and marine biodiversity. The region’s ice-covered expanses provide essential breeding and feeding grounds for a diverse assemblage of marine species, who have adapted to thrive in these harsh conditions and consequently are under threat from global warming. The bearded seal (Erignathus barbatus) is an ice-obligate Arctic species using sea-ice for all aspects of its life-history, rendering it particularly vulnerable to sea-ice loss. It is one of the least studied and hence enigmatic of the Arctic marine mammals, with little knowledge regarding genetic structure, diversity, adaptations and demographic history, consequently hampering management and conservation efforts. Here, we sequenced 70 whole nuclear genomes from across most of the species’ circumpolar range, finding significant genetic structure between the Pacific and the Atlantic subspecies, which diverged during the Penultimate Glacial Period (~192 KYA). Remarkably, we found fine-scale genetic structure within both subspecies, with at least two distinct populations in the Pacific and three in the Atlantic. We hypothesize sea-ice dynamics and bathymetry had a prominent role of in shaping bearded seal genetic structure and diversity. Resulting genomic data can be used to complement the health, physiological, and behavioral research needed to conserve this species. In addition, we provide recommendations for management units that can be used to more specifically assess climatic and anthropogenic impacts on bearded seal populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».