Genomics for species delineation and conservation status determination: the Black Maple as a case study
Notice bibliographique
Résumé
The assessment of the conservation status of species is crucial to effective conservation strategies, particularly in the current context of global changes. However, the quality of these assessments can be undermined by taxonomic uncertainties. One such case is the black maple whose conservation status is incongruent among Canadian provinces and American states where it naturally occurs. Morphological disparities between sugar maple and black maple led to their description as distinct species at the end of the 19th century, yet extensive hybridization between the two forms and low genetic differentiation has been reported since. The consensus on the taxonomical designation of black maple remains elusive and is sometimes recognised as a subspecies or ecotype of the sugar maple. To further investigate genetic distinctiveness of sugar and black maple, we analyzed high-throughput sequencing data obtained from two 700-meters apart stands within a contiguous forest where the two maples coexist. We sampled groups of individuals presenting the typical morphological characters of limb outlines and pubescence of each maple. Genetic data unveiled substantial differentiation between these two maples, confirming the distinctiveness of the black maple gene pools and justifying its recognition as a distinct species. Furthermore, black maple populations in Quebec exhibited markedly greater genetic structure and inbreeding compared to their sugar maple counterparts at equivalent latitudes. These findings not only affirm the species-level taxonomy of black maple but also represent the first characterization of genetic diversity within populations situated at the northern edge of its distribution range. Its high level of inbreeding is concerning for the conservation of the species in Quebec, and more research is needed to identify its origin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».