The infants’ gut microbiome: setting the stage for the early onset of obesity
Notice bibliographique
Résumé
In the past three decades, dietary and lifestyle changes worldwide have resulted in a global increase in the prevalence of obesity in both adults and children. Known to be highly influenced by genetic, environmental and lifestyle factors, obesity is characterized by a low-grade chronic inflammation that contributes to the development of other metabolic diseases such as diabetes and cardiovascular disease. Recently, the gut microbiome has been added as a cause/contributor to the development of obesity. As differences in the microbiome between obese and normoweight individuals have been observed, we set out to determine whether infants harbor an obesogenic microbiome early on and whether the pre-pregnancy status of the mother (obese or normoweight) is correlated to their infant’s microbiome composition. Using shotgun sequencing, we analyzed stool samples throughout the first year of life from infants born to obese (n = 23 participants, m = 104 samples) and normoweight (n = 23 participants, m = 99 samples) mothers. We found that the infants’ microbiome diversity at taxonomic and functional levels was significantly influenced by time (ANOVA p < 0.001) but not by the mother’s pre-pregnancy status. Overall, no deterministic succession of taxa or functions was observed. However, infants born to obese mothers were found to have a significantly higher Bacillota/Bacteroidota ratio (p = 0.02) at six months, were significantly depleted from six months old of the well-established obesity biomarkers Akkermansia municiphila and Faecalibacterium prausnitzii (p < 0.01), and were at one week old, significantly enriched in pathways such as the UDP-N-acetyl-D-glucosamine biosynthesis II (p = 0.02) involved in leptin production, suggesting perhaps that there may exist some underlying mechanisms that dictate the development of an obesogenic microbiota early on.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».