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Enregistrement W4400694669 · doi:10.3114/sim.2024.108.01

What are the 100 most cited fungal genera?

2024· article· en· W4400694669 sur OpenAlexaff
C.S. Bhunjun, Yijun Chen, Chayanard Phukhamsakda, T. Boekhout, J.Z. Groenewald, E.H.C. McKenzi, Elaine Cristina Francisco, Jens C. Frisvad, Marizeth Groenewald, Vedprakash G. Hurdeal, Janet Jennifer Luangsa-ard, Giancarlo Perrone, Cobus M. Visagie, Feng‐Yan Bai, Janusz Błaszkowski, Uwe Braun, Francisco Adriano de Souza, Mariana Bessa de Queiroz, Arun Kumar Dutta, Didsanutda Gonkhom, Bruno Tomio Goto, Vladimiro Guarnaccia, Ferry Hagen, Jos Houbraken, Marc-André Lachance, J.J. Li, Kaiyu Luo, Franco Magurno, Suchada Mongkolsamrit, Vincent Robert, N. Roy, Saowaluck Tibpromma, Dhanushka N. Wanasinghe, Dongqi Wang, Dapeng Wei, Changlin Zhao, Waraporn Aiphuk, Olutoyosi O. Ajayi-Oyetunde, Thales Domingos Arantes, Jamayra Conceição de Araújo, Dominik Begerow, Mounes Bakhshi, Renan do Nascimento Barbosa, Falk Hubertus Behrens, Konstanze Bensch, Jadson Diogo Pereira Bezerra, Piotr Bilański, Carl A. Bradley, Ben Bubner, Treena I. Burgess, Bart Buyck, Neža Čadež, F.J.S. Calaça, Lucy J. Campbell, Priscila Chaverrí, Yongyan Chen, K. W. Thilini Chethana, Beatrix Coetzee, Marileide M. Costa, Qian Chen, Fábio Alex Custódio, Yu‐Cheng Dai, Ulrike Damm, A.L.C.M.A. Santiago, Rita Milvia De Miccolis Angelini, Jan Dijksterhuis, Asha J. Dissanayake, Mingkwan Doilom, E. Álvarez-Duarte, Michael Fischer, Achala J. Gajanayake, Josepa Gené, Deecksha Gomdola, André Ângelo Medeiros Gomes, Gerlinde Hausner, Mao-Qiang He, Liping Hou, Isabel Iturrieta‐González, Fahimeh Jami, Robert Jankowiak, Ruvishika S. Jayawardena, Hazal Kandemir, Levente Kiss, Noppol Kobmoo, T. Kowalski, L. Landi, J.K. Liu, Xiaobo Liu, M. Loizides, Thatsanee Luangharn, Sajeewa S. N. Maharachchikumbura, Gugulethu Joy Makhathini Mkhwanazi, Ishara S. Manawasinghe, Yasmina Marín-Felix, Alistair R. McTaggart, Pierre‐Arthur Moreau, Olga Morozova, L. Mostert, Heinz D. Osiewacz, Dhandevi Pem, Rungtiwa Phookamsak, Stefania Pollastro, A. Pordel, Caroline Poyntner, Alan J. L. Phillips, Monthien Phonemany, Itthayakorn Promputtha, Achala R. Rathnayaka, Ana María Rodrigues, Gianfranco Romanazzi, Lisa Ann Rothmann, Catalina Salgado‐Salazar, Marcelo Sandoval‐Denis, Sven J. Saupe, Markus Scholler, Peter Scott, Roger G. Shivas, P. Silar, Alexandre G. S. Silva-Filho, Cristina Maria de Souza‐Motta, Christoffel F. J. Spies, Alberto M. Stchigel, Katja Sterflinger, Richard C. Summerbell, Tatyana Svetasheva, Susumu Takamatsu, Bart Theelen, Raquel Cordeiro Theodoro, Marco Thines, Naritsada Thongklang, Rosário Torres, Benedetta Turchetti, Tom van den Brule, X W Wang, Felipe Wartchow, Stéphane Welti, Subodini N. Wijesinghe, Fang Wu, Rong Xu, Zhenyuan Yang, Neriman Yılmaz, Andrey Yurkov, Lin Zhao, Rengui Zhao, Ni Zhou, Kevin D. Hyde, P.W. Crous

Notice bibliographique

RevueStudies in Mycology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensPublic Health OntarioUniversity of TorontoWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The global diversity of fungi has been estimated between 2 to 11 million species, of which only about 155 000 have been named. Most fungi are invisible to the unaided eye, but they represent a major component of biodiversity on our planet, and play essential ecological roles, supporting life as we know it. Although approximately 20 000 fungal genera are presently recognised, the ecology of most remains undetermined. Despite all this diversity, the mycological community actively researches some fungal genera more commonly than others. This poses an interesting question: why have some fungal genera impacted mycology and related fields more than others? To address this issue, we conducted a bibliometric analysis to identify the top 100 most cited fungal genera. A thorough database search of the Web of Science, Google Scholar, and PubMed was performed to establish which genera are most cited. The most cited 10 genera are Saccharomyces, Candida, Aspergillus, Fusarium, Penicillium, Trichoderma, Botrytis, Pichia, Cryptococcus and Alternaria. Case studies are presented for the 100 most cited genera with general background, notes on their ecology and economic significance and important research advances. This paper provides a historic overview of scientific research of these genera and the prospect for further research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesBibliométrie
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,930
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0700,106
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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