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Enregistrement W4400747451 · doi:10.1038/s41467-024-50267-3

Neurostructural subgroup in 4291 individuals with schizophrenia identified using the subtype and stage inference algorithm

2024· article· en· W4400747451 sur OpenAlexafffund
Yuchao Jiang, Cheng Luo, Jijun Wang, Lena Palaniyappan, Xiao Chang, Shitong Xiang, Jie Zhang, Mingjun Duan, Huan Huang, Christian Gaser, Kiyotaka Nemoto, Kenichiro Miura, Ryota Hashimoto, Lars T. Westlye, Geneviève Richard, Sara Fernández‐Cabello, Nadine Parker, Ole A. Andreassen, Tilo Kircher, Igor Nenadić, Frederike Stein, Florian Thomas‐Odenthal, Lea Teutenberg, Paula Usemann, Udo Dannlowski, Tim Hahn, Dominik Grotegerd, Susanne Meinert, Rebekka Lencer, Yingying Tang, Tianhong Zhang, Chunbo Li, Weihua Yue, Yuyanan Zhang, Xin Yu, Enpeng Zhou, Ching‐Po Lin, Shih‐Jen Tsai, Amanda Rodrigue, David C. Glahn, Godfrey D. Pearlson, John Blangero, Andriana Karuk, Edith Pomarol‐Clotet, Raymond Salvador, Paola Fuentes‐Claramonte, María Ángeles García‐León, Gianfranco Spalletta, Fabrizio Piras, Daniela Vecchio, Nerisa Banaj, Jingliang Cheng, Zhening Liu, Jie Yang, Ali Saffet Gönül, Özgül Uslu, Birce Begüm Burhanoğlu, Aslihan Uyar-Demir, Kelly Rootes-Murdy, Vince D. Calhoun, Kang Sim, Melissa J. Green, Yann Quidé, Young‐Chul Chung, Woo‐Sung Kim, Scott R. Sponheim, Caroline Demro, Ian S. Ramsay, Felice Iasevoli, Andrea de Bartolomeis, Annarita Barone, Mariateresa Ciccarelli, Arturo Brunetti, Sirio Cocozza, Giuseppe Pontillo, Mario Tranfa, Min Tae M Park, Matthias Kirschner, Foivos Georgiadis, Stefan Kaiser, Tamsyn E. Van Rheenen, Susan L. Rossell, Matthew Hughes, Will Woods, Sean Carruthers, Philip Sumner, Elysha Ringin, Filip Španiel, Antonín Škoch, David Tomeček, Philipp Homan, Stephanie Homan, Wolfgang Omlor, Giacomo Cecere, Dana D. Nguyen, Adrian Preda, Sophia I. Thomopoulos, Neda Jahanshad, Long‐Biao Cui, Dezhong Yao, Paul M. Thompson, Jessica A. Turner, Theo G.M. van Erp, Wei Cheng, Jianfeng Feng

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthSchool of Medicine, Shanghai Jiao Tong UniversityInstituto de Salud Carlos IIIHigher Education Discipline Innovation ProjectUniversity of TsukubaTaipei Veterans General HospitalPeking UniversityCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalShanghai Jiao Tong UniversityNational Center of Neurology and PsychiatryFudan UniversityUniversity of Electronic Science and Technology of ChinaUniversitetet i OsloWestfälische Wilhelms-Universität MünsterChina Postdoctoral Science FoundationChinese Academy of Medical SciencesMcGovern Institute for Brain Research, Massachusetts Institute of TechnologyMinistry of Education, IndiaNational Natural Science Foundation of ChinaShanghai Educational Development FoundationScience and Technology Commission of Shanghai MunicipalityShanghai Rising-Star ProgramMcGill UniversityInstitute for Translational NeuroscienceMedical Research Council Centre for Neurodevelopmental DisordersUniversitätsklinikum Jena
Mots-clésInferenceSchizophrenia (object-oriented programming)NeuroimagingStriatumArtificial intelligencePsychologyNeuroscienceComputer sciencePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Machine learning can be used to define subtypes of psychiatric conditions based on shared biological foundations of mental disorders. Here we analyzed cross-sectional brain images from 4,222 individuals with schizophrenia and 7038 healthy subjects pooled across 41 international cohorts from the ENIGMA, non-ENIGMA cohorts and public datasets. Using the Subtype and Stage Inference (SuStaIn) algorithm, we identify two distinct neurostructural subgroups by mapping the spatial and temporal 'trajectory' of gray matter change in schizophrenia. Subgroup 1 was characterized by an early cortical-predominant loss with enlarged striatum, whereas subgroup 2 displayed an early subcortical-predominant loss in the hippocampus, striatum and other subcortical regions. We confirmed the reproducibility of the two neurostructural subtypes across various sample sites, including Europe, North America and East Asia. This imaging-based taxonomy holds the potential to identify individuals with shared neurobiological attributes, thereby suggesting the viability of redefining existing disorder constructs based on biological factors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,036

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,050
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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