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Enregistrement W4400760790 · doi:10.1371/journal.ppat.1012161

Evolutionary insights into the emergence of virulent Leptospira spirochetes

2024· article· en· W4400760790 sur OpenAlexafffund
Alexandre Giraud-Gatineau, Cecilia Nieves, Luke B. Harrison, Nadia Benaroudj, Frédéric J. Veyrier, Mathieu Picardeau

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueLeptospirosis research and findings
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesInstitut PasteurNational Institutes of HealthAgence Nationale de la RechercheFonds de Recherche du Québec - SantéNational Institute of Health Sciences
Mots-clésVirulenceLeptospiraBiologyAdaptation (eye)Leptospira interrogansLineage (genetic)Host adaptationHost (biology)MicrobiologyGeneticsEvolutionary biologySerotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogenic Leptospira are spirochete bacteria which cause leptospirosis, a re-emerging zoonotic disease of global importance. Here, we use a recently described lineage of environmental-adapted leptospires, which are evolutionarily the closest relatives of the highly virulent Leptospira species, to explore the key phenotypic traits and genetic determinants of Leptospira virulence. Through a comprehensive approach integrating phylogenomic comparisons with in vitro and in vivo phenotyping studies, we show that the evolution towards pathogenicity is associated with both a decrease of the ability to survive in the environment and the acquisition of strategies that enable successful host colonization. This includes the evasion of the mammalian complement system and the adaptations to avoid activation of the innate immune cells by the highly-virulent Leptospira species (also called P1+ species), unlike other species belonging to the phylogenetically related P1- and P2 groups, as well as saprophytes. Moreover, our analysis reveals specific genetic determinants that have undergone positive selection during the course of evolution in Leptospira, contributing directly to virulence and host adaptation as demonstrated by gain-of-function and knock-down studies. Taken together, our findings define a new vision on Leptospira pathogenicity, identifying virulence attributes associated with clinically relevant species, and provide insights into the evolution and emergence of these life-threatening pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,141
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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