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Enregistrement W4400773688 · doi:10.26685/urncst.611

The Effects of Alistipes-Produced GABA on the Murine Gut-Brain Serotonergic System and Major Depressive Disorder: A Research Protocol

2024· article· en· W4400773688 sur OpenAlexaff
Jia N. Vedante, Julia C. Ingarao

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGABA and Rice Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSerotonergicNeurosciencePsychologyMajor depressive disorderGut–brain axisClinical psychologyPsychiatryMedicineSerotoninInternal medicineCognitionDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Inspired by the link established between gut dysbiosis and Major Depressive Disorder (MDD), this research protocol aims to clarify the role of Alitsipes bacteria in the context of this disorder. Gut dysbiosis has been implicated in MDD, but the specific role of the Alistipes genus remains unclear. Alistipes, being an underrepresented constituent of gut microbiome-related literature, were chosen as a potential link to MDD via the hypothesized pathway of Alistipes-released GABA, subsequent production of serotonin from enterochromaffin (EC) cells, and eventual vagus nerve stimulation. Methods: Four groups of 60 male adult gnotobiotic mice (strain C57BL/6) will be inoculated with different levels of Alistipes bacteria (none, low, baseline, high). Experiment 1 aims to understand the localization and quantity of Alistipes-derived GABA using PET/MRI. Subsequently, either bicuculline (a GABAA receptor antagonist), CGP56433A (a GABAB receptor antagonist), both in conjunction, or neither will be administered to understand how serotonin output varies based on GABAergic activity; PET/MRI will be used again for serotonin visualization. Lastly, an in-vivo whole-cell patch clamp experiment will help quantitatively assess vagus nerve stimulation resulting from serotonin secretion. Results: We hypothesize that GABA in the GI tract will be localized at EC cells, and that inhibiting GABAB receptors will produce the highest serotonin output and subsequently the greatest vagus nerve stimulation. Discussion: Current literature postulates that higher GABAB activity correlates with worse MDD symptoms, supporting the therapeutic potential of antagonizing this receptor’s activity. The serotonin output-related excitatory GABAA receptor responses are well known, calling for the exploration of the optimal combination of Alistipes concentration to support GABAA activity and proper dosage to block GABAB receptors. Conclusion: This study may have clinical implications for MDD therapies seeing that Selective Serotonin Reuptake Inhibitor treatments are ineffective for many patients; approaching this problem by drawing clearer conclusions about how GABA in the gut affects serotonergic activity in the brain and other nervous system components may help devise more novel treatments. If the proposed pathway holds true, a probiotic to help regulate the Alistipes level in the gut may serve as a potential therapeutic direction to take for such treatments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,408
Écart entre enseignants0,359 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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