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Enregistrement W4400775443 · doi:10.7554/elife.91766.3.sa2

Author response: Netrin signaling mediates survival of dormant epithelial ovarian cancer cells

2024· peer-review· en· W4400775443 sur OpenAlexaff
Pirunthan Perampalam, James I. MacDonald, Komila Zakirova, Daniel T. Passos, Sumaiyah Wasif, Yudith Ramos-Valdes, Maëva Hervieu, Patrick Mehlen, Robert Rottapel, Benjamin Gibert, Rohann JM Correa, Trevor G. Shepherd, Frederick A. Dick

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNetrinOvarian cancerEpithelial ovarian cancerBiologyCancer researchCell biologyCancerMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-grade serous ovarian cancer (or HGSOC for short) is the fifth leading cause of cancer-related deaths in women. It is generally diagnosed at an advanced stage of disease when the cancer has already spread to other parts of the body. Surgical removal of tumors and subsequent treatment with chemotherapy often reduces the signs and symptoms of the disease for a time but some cancer cells tend to survive so that patients eventually relapse. The HGSOC cells typically spread from the ovaries by moving through the liquid surrounding organs in the abdomen. The cells clump together and enter an inactive state known as dormancy that allows them to survive chemotherapy and low-nutrient conditions. Understanding how to develop new drug therapies that target dormant cancer cells is thought to be an important step in prolonging the life of HGSOC patients. Cancer cells are hardwired to multiply and grow, so Perampalam et al. reasoned that becoming dormant poses challenges for HGSOC cells, which may create unique vulnerabilities not shared by proliferating cancer cells. To find out more, the researchers used HGSOC cells that had been isolated from patients and grown in the laboratory. The team used a gene editing technique to screen HGSOC cells for genes required by the cells to survive when they are dormant. The experiments found that genes involved in a cell signaling pathway, known as Netrin signaling, were critical for the cells to survive. Previous studies have shown that Netrin signaling helps the nervous system form in embryos and inhibits a program of controlled cell death in some cancers. Perampalam et al. discovered that Netrins were present in the environment immediately surrounding dormant HGSOC cells. Human HGSOC patients with higher levels of Netrin gene expression had poorer prognoses than patients with lower levels of Netrin gene expression. Further experiments demonstrated that Netrins help dormant HGSOC cells to spread around the body. These findings suggest that Netrin signalling may provide useful targets for future drug therapies against dormant cells in some ovarian cancers. This could include repurposing drugs already in development or creating new inhibitors of this pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,244

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0050,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0730,022

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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