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Enregistrement W4400776976 · doi:10.1021/acsinfecdis.4c00284

Evaluation of the <i>Leishmania</i> Inositol Phosphorylceramide Synthase as a Drug Target Using a Chemical and Genetic Approach

2024· article· en· W4400776976 sur OpenAlexafffund
Edubiel A. Alpizar-Sosa, Flávia M. Zimbres, Brian S. Mantilla, Emily A. Dickie, Wenbin Wei, Gabriela A. Burle-Caldas, Laura N. S. Filipe, Katrien Van Bocxlaer, Helen P. Price, Ana Victoria Ibarra‐Meneses, Francis Beaudry, Christopher Fernandez‐Prada, Phillip D. Whitfield, Michael P. Barrett, Paul W. Denny

Notice bibliographique

RevueACS Infectious Diseases · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilDurham UniversityUniversité de MontréalUK Research and InnovationResearch Councils UKUniversity of Bern
Mots-clésSphingolipidBiologyLeishmaniaDrug discoveryIn vivoMetabolomicsComputational biologyBiochemistryCell biologyGeneticsBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High Resolution Image Download MS PowerPoint Slide The lack of effective vaccines and the development of resistance to the current treatments highlight the urgent need for new anti-leishmanials. Sphingolipid metabolism has been proposed as a promising source of Leishmania -specific targets as these lipids are key structural components of the eukaryotic plasma membrane and are involved in distinct cellular events. Inositol phosphorylceramide (IPC) is the primary sphingolipid in the Leishmania species and is the product of a reaction mediated by IPC synthase (IPCS). The antihistamine clemastine fumarate has been identified as an inhibitor of IPCS in L. major and a potent anti-leishmanial in vivo . Here we sought to further examine the target of this compound in the more tractable species L. mexicana, using an approach combining genomic, proteomic, metabolomic and lipidomic technologies, with molecular and biochemical studies. While the data demonstrated that the response to clemastine fumarate was largely conserved, unexpected disturbances beyond sphingolipid metabolism were identified. Furthermore, while deletion of the gene encoding Lmx IPCS had little impact in vitro, it did influence clemastine fumarate efficacy and, importantly, in vivo pathogenicity. Together, these data demonstrate that clemastine does inhibit Lmx IPCS and cause associated metabolic disturbances, but its primary target may lie elsewhere.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,350
Score d'incertitude au seuil0,547

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,312
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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