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Enregistrement W4400803404 · doi:10.1016/j.jsbmb.2024.106588

PSA, an outdated biomarker for prostate cancer: In search of a more specific biomarker, citrate takes the spotlight

2024· review· en· W4400803404 sur OpenAlexafffund
Lucas Galey, Ayokunle O. Olanrewaju, Hermann Nabi, Jean‐Sébastien Paquette, Frédéric Pouliot, Étienne Audet‐Walsh

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensCentre intégré de santé et de services sociaux de Chaudière-AppalachesUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésProstate cancerOverdiagnosisBiomarkerProstate-specific antigenContext (archaeology)False positive paradoxMedicineBiomarker discoveryProstateCancerPCA3OncologyInternal medicineComputer scienceBiologyArtificial intelligenceProteomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The prevailing biomarker employed for prostate cancer (PCa) screening and diagnosis is the prostate-specific antigen (PSA). Despite excellent sensitivity, PSA lacks specificity, leading to false positives, unnecessary biopsies and overdiagnosis. Consequently, PSA is increasingly less used by clinicians, thus underscoring the imperative for the identification of new biomarkers. An emerging biomarker in this context is citrate, a molecule secreted by the normal prostate, which has been shown to be inversely correlated with PCa. Here, we discuss about PSA and its usage for PCa diagnosis, its lack of specificity, and the various conditions that can affect its levels. We then provide our vision about what we think would be a valuable addition to our PCa diagnosis toolkit, citrate. We describe the unique citrate metabolic program in the prostate and how this profile is reprogrammed during carcinogenesis. Finally, we summarize the evidence that supports the usage of citrate as a biomarker for PCa diagnosis, as it can be measured in various patient samples and be analyzed by several methods. The unique relationship between citrate and PCa, combined with the stability of citrate levels in other prostate-related conditions and the simplicity of its detection, further accentuates its potential as a biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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