MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4400835656 · doi:10.20944/preprints202407.1459.v1

Optimising Clinical Epidemiology in Disease Outbreaks: Analysis of ISARIC-WHO COVID-19 Case Report Form Utilisation

2024· preprint· en· W4400835656 sur OpenAlexfundno aff
Laura Merson, Sara Duque, Esteban García-Gallo, Trokon Omarley Yeabah, Jamie Rylance, Janet Dı́az, Antoine Flahault

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIMedical Research CouncilNational Institutes of HealthKementerian Kesihatan MalaysiaAll-India Institute of Medical SciencesPrince Charles Hospital FoundationForeign, Commonwealth and Development OfficeNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitUniversity of OxfordNorges ForskningsrådUniversity of Cape TownPublic Health EnglandWellcome TrustUniversity College DublinCanadian Institutes of Health ResearchImperial College LondonMedical Research Charities GroupEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsNational Institute for Health and Care ResearchJST-Mirai ProgramMinistero della SaluteInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleSunnybrook Research InstituteEuropean CommissionBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésCRFSData collectionOutbreakMedicineDemographicsData qualityPsychological interventionEpidemiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Quality managementClinical trialConsistency (knowledge bases)Infectious disease (medical specialty)DiseaseConditional random fieldComputer scienceStatisticsInternal medicineOperations managementDemographyNursingPathologyArtificial intelligenceMathematicsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Standardised forms for capturing clinical data promote consistency in data collection and analysis across study sites, enabling faster, higher-quality evidence generation. ISARIC and the World Health Organization have developed case report forms (CRFs) for the clinical characterisation of several infectious disease outbreaks. To improve the design and quality of future forms, we analysed the inclusion and completion rates of the 243 fields on the ISARIC-WHO COVID-19 CRF. Data from 42 diverse collaborations, covering 1,886 hospitals and 950,064 patients were analysed. A mean of 129.6 fields (53%) were included in the adapted CRFs implemented across the sites. Consistent patterns of field inclusion and completion aligned with globally recognised research priorities in outbreaks of novel infectious diseases. Outcome status was the most highly included (95.2%) and completed (89.8%) field, followed by admission demographics (79.1% and 91.6%), comorbidities (77.9% and 79.0%), signs & symptoms (68.9% and 78.4%) and vitals (70.3% and 69.1%). Mean field completion was higher in severe patients (70.2%) than in all patients (61.6%). The results indicate that clinical characterisation CRFs can be streamlined to reduce data collection time, including the modularisation of CRFs to offer a choice of data volume collection and the separation of critical care interventions. This data-driven approach to designing CRFs enhances the efficiency of data collection to inform patient care and public health response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,121
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,317
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,879
Score d'incertitude au seuil0,640

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1210,317
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0080,012
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0020,004
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,401
Tête enseignante GPT0,531
Écart entre enseignants0,130 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePreprints.orgMême sujetMachine Learning in HealthcareTravaux en français237 207