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Enregistrement W4400892821 · doi:10.1136/gutjnl-2024-332730

Faecal proteomics links neutrophil degranulation with mortality in patients with alcohol-associated hepatitis

2024· article· en· W4400892821 sur OpenAlexafffund
Henriette Kreimeyer, Carlos G. Gonzalez, Marcos F. Fondevila, Cynthia L. Hsu, Phillipp Hartmann, Xinlian Zhang, Peter Stärkel, Francisco Bosques‐Padilla, Elizabeth C. Verna, Juan G. Abraldeṣ, Robert S. Brown, Vı́ctor Vargas, José Altamirano, Juan Caballería, Debbie L. Shawcross, Alexandre Louvet, Michael R. Lucey, Philippe Mathurin, Guadalupe García–Tsao, Ramón Bataller, David J. Gonzalez, Bernd Schnabl

Notice bibliographique

RevueGut · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlcohol Consumption and Health Effects
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesSan Diego Digestive Diseases Research Center, School of Medicine, University of California, San DiegoEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesUniversity of California, San DiegoNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismDeutsche ForschungsgemeinschaftU.S. Department of Veterans AffairsUniversity of AlbertaGilead SciencesNational Institute of General Medical SciencesOffice of Research and DevelopmentNational Institutes of HealthAmerican Association for the Study of Liver DiseasesAstraZeneca
Mots-clésDegranulationMedicineAlcoholic hepatitisHepatitisProteomicsImmunologyInternal medicineGastroenterologyBiologyAlcoholic liver diseaseCirrhosisBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Patients with alcohol-associated hepatitis (AH) have a high mortality. Alcohol exacerbates liver damage by inducing gut dysbiosis, bacterial translocation and inflammation, which is characterised by increased numbers of circulating and hepatic neutrophils. DESIGN: In this study, we performed tandem mass tag (TMT) proteomics to analyse proteins in the faeces of controls (n=19), patients with alcohol-use disorder (AUD; n=20) and AH (n=80) from a multicentre cohort (InTeam). To identify protein groups that are disproportionately represented, we conducted over-representation analysis using Reactome pathway analysis and Gene Ontology to determine the proteins with the most significant impact. A faecal biomarker and its prognostic effect were validated by ELISA in faecal samples from patients with AH (n=70), who were recruited in a second and independent multicentre cohort (AlcHepNet). RESULT: Faecal proteomic profiles were overall significantly different between controls, patients with AUD and AH (principal component analysis p=0.001, dissimilarity index calculated by the method of Bray-Curtis). Proteins that showed notable differences across all three groups and displayed a progressive increase in accordance with the severity of alcohol-associated liver disease were predominantly those located in neutrophil granules. Over-representation and Reactome analyses confirmed that differentially regulated proteins are part of granules in neutrophils and the neutrophil degranulation pathway. Myeloperoxidase (MPO), the marker protein of neutrophil granules, correlates with disease severity and predicts 60-day mortality. Using an independent validation cohort, we confirmed that faecal MPO levels can predict short-term survival at 60 days. CONCLUSIONS: We found an increased abundance of faecal proteins linked to neutrophil degranulation in patients with AH, which is predictive of short-term survival and could serve as a prognostic non-invasive marker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,404

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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