Clinical and Genomic Risk for Late Breast Cancer Recurrence and Survival
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The 21-gene recurrence score (RS) assay (Oncotype DX) is used to guide adjuvant chemotherapy use for patients with hormone receptor-positive, HER2 (human epidermal growth factor receptor 2)-negative, axillary node-negative breast cancer. Its role, however, in providing prognostic information for late distant recurrence when added to clinicopathologic prognostic factors is unknown. METHODS: A patient-specific meta-analysis including 10,004 women enrolled in three trials was updated using extended follow-up data from TAILORx, integrating the RS with histologic grade, tumor size, and age at surgery for the RSClin tool. Cox models integrating clinicopathologic factors and the RS were compared by using likelihood ratio (LR) tests. External validation of prognosis for distant recurrence in years 0 to 10 and 5 to 10 was performed in an independent cohort of 1098 women in a real-world registry. RESULTS: RSClin provided significantly more prognostic information than either the clinicopathologic factors (ΔLR chi-square, 86.2; P<0.001) or RS alone (ΔLR chi-square, 131.0; P<0.001). The model was prognostic in an independent cohort for distant recurrence by 10 years after diagnosis (standardized hazard ratio, 1.56; 95% confidence interval, 1.25 to 1.94), was associated with late distant recurrence risk between 5 and 10 years after diagnosis (standardized hazard ratio, 1.78; 95% confidence interval, 1.25 to 2.55), and approximated the observed 10-year distant recurrence risk (Lin concordance, 0.87) and 5- to 10-year distant recurrence risk (Lin concordance, 0.92). CONCLUSIONS: The 21-gene RS is prognostic for distant recurrence and overall survival in early breast cancer. A model integrating the 21-gene RS and clinicopathologic factors improved estimates of distant recurrence risk compared with either used individually and stratified late distant recurrence risk. (Funded by the National Cancer Institute, National Institutes of Health [U10CA180820, U10CA180794, UG1CA189859, U10CA180868, and U10CA180822] and others.).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,005 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».