Abstract 2119: Transcriptomic Profiling Reveals Therapeutic Potential Of Docosahexaenoic Acid For SARS Coronaviruses Infection Management
Notice bibliographique
Résumé
Prior work from our laboratory not only suggested that docosahexaenoic acid (DHA) may upregulate immune response pathways in human monocytes, it also revealed that DHA reduces angiotensin converting enzyme 2 (ACE2), the cellular receptor for SARS coronaviruses (SARS-CoV), in various rat tissues and human cultured cells. Also, DHA was found to inhibit cellular entry of SARS-CoV-2 pseudovirus. Thus, it was hypothesized that DHA has the potential to help manage SARS-CoV infection. RNA-seq was performed on DHA-treated (20 or 125 μM for 8 h) and control human EA.hy926 cells in both the growing and quiescent states. The data were processed by the RSEM-STAR-DESeq2 pipeline, and then subjected to gene set enrichment analysis (GSEA) with clusterProfiler. GSEA revealed that only in quiescent cells, 20 μM DHA downregulated pathways related to SARS-CoV-1/2-host interactions, specifically the processes by which the virus disrupts host protein translation and global mRNA splicing to suppress host defenses. The Reactome term “potential therapeutics for SARS” was positively enriched by both 20 and 125 μM DHA in quiescent cells only, including genes related to nuclear factor erythroid 2-related factor 2 (Nrf2) pathway, interleukin-6 pathway, heat shock proteins, and TBK1 . However, in growing cells, terms related to SARS-CoV-1/2-host interactions were upregulated by DHA. Beyond derailing SARS-CoV via translation machinery and ACE2, DHA was also previously found to concomitantly reduce ACE1 protein levels, thus preserving the ACE1/ACE2 balance. This is significant because the balance of ACE1/ACE2 is important for maintaining renin-angiotensin system homeostasis, a factor critical in the pathogenesis of long COVID. Overall, our findings advance a novel perspective on the therapeutic potential of DHA for managing SARS-CoV infection, via its ability to hinder virus-host interactions. Moreover, the beneficial effects of DHA only occurred in quiescent (healthy) endothelial cells but not growing (dysfunctional) endothelial cells, implying that COVID-19 patients without CVD may be more responsive to DHA treatment compared to patients with underlying CVD. Further in vitro , in vivo , and even clinical studies are required to validate these effects of DHA on SARS-CoV.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».