MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4400934671 · doi:10.1161/atvb.44.suppl_1.2119

Abstract 2119: Transcriptomic Profiling Reveals Therapeutic Potential Of Docosahexaenoic Acid For SARS Coronaviruses Infection Management

2024· article· en· W4400934671 sur OpenAlexaff
Shiqi Huang, Carla G. Taylor, Peter Zahradka

Notice bibliographique

RevueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular Biology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueFatty Acid Research and Health
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDocosahexaenoic acidCoronavirus disease 2019 (COVID-19)TranscriptomeSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)CoronavirusMedicineCoronavirus InfectionsProfiling (computer programming)2019-20 coronavirus outbreakVirologyPandemicBiologyImmunologyDiseaseInfectious disease (medical specialty)Internal medicinePolyunsaturated fatty acidGene expressionFatty acidComputer scienceOutbreakGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prior work from our laboratory not only suggested that docosahexaenoic acid (DHA) may upregulate immune response pathways in human monocytes, it also revealed that DHA reduces angiotensin converting enzyme 2 (ACE2), the cellular receptor for SARS coronaviruses (SARS-CoV), in various rat tissues and human cultured cells. Also, DHA was found to inhibit cellular entry of SARS-CoV-2 pseudovirus. Thus, it was hypothesized that DHA has the potential to help manage SARS-CoV infection. RNA-seq was performed on DHA-treated (20 or 125 μM for 8 h) and control human EA.hy926 cells in both the growing and quiescent states. The data were processed by the RSEM-STAR-DESeq2 pipeline, and then subjected to gene set enrichment analysis (GSEA) with clusterProfiler. GSEA revealed that only in quiescent cells, 20 μM DHA downregulated pathways related to SARS-CoV-1/2-host interactions, specifically the processes by which the virus disrupts host protein translation and global mRNA splicing to suppress host defenses. The Reactome term “potential therapeutics for SARS” was positively enriched by both 20 and 125 μM DHA in quiescent cells only, including genes related to nuclear factor erythroid 2-related factor 2 (Nrf2) pathway, interleukin-6 pathway, heat shock proteins, and TBK1 . However, in growing cells, terms related to SARS-CoV-1/2-host interactions were upregulated by DHA. Beyond derailing SARS-CoV via translation machinery and ACE2, DHA was also previously found to concomitantly reduce ACE1 protein levels, thus preserving the ACE1/ACE2 balance. This is significant because the balance of ACE1/ACE2 is important for maintaining renin-angiotensin system homeostasis, a factor critical in the pathogenesis of long COVID. Overall, our findings advance a novel perspective on the therapeutic potential of DHA for managing SARS-CoV infection, via its ability to hinder virus-host interactions. Moreover, the beneficial effects of DHA only occurred in quiescent (healthy) endothelial cells but not growing (dysfunctional) endothelial cells, implying that COVID-19 patients without CVD may be more responsive to DHA treatment compared to patients with underlying CVD. Further in vitro , in vivo , and even clinical studies are required to validate these effects of DHA on SARS-CoV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArteriosclerosis Thrombosis and Vascular BiologyMême sujetFatty Acid Research and HealthTravaux en français237 207