Comparative genomic and phylogenetic analysis of the complete mitochondrial genome of <i>Cricula trifenestrata</i> (Helfer) among lepidopteran insects
Notice bibliographique
Résumé
Cricula trifenestrata Helfer (commonly known as Amphutukoni muga/Cricula silkworm), a wild sericigenous insect produces golden yellow silk similar to Antheraea assamensis (muga silkworm), with significant potential as a natural fiber and biomaterial. Cricula is considered as a pest as it competes for food with muga, which produces the prized golden silk. This study focuses on decoding the mitochondrial genome of C. trifenestrata using next-generation sequencing technology and includes comparative analysis with Bombycoids and other lepidopteran insects. We found that the Cricula mitogenome spans 15 425 bp and exhibits typical gene content and arrangement consistent with other Saturniids and lepidopterans. All protein-coding genes were found to undergo purifying selection, with the highest and lowest conservation observed in the cox1 and atp8 gene, respectively, indicating their potential role in future evolutionary events. We identified two types of mismatches: 23 “G–U” and 6 “U–U” pairs, similar to those found in Actias selene among the Saturniids. Additionally, our study uncovered the presence of two 33 bp repeat units and a “TTAGA” motif in the control region, in contrast to the typical “ATAGA” motif, suggesting functional similarity with evolving sequences. Furthermore, phylogenetic analysis supports the close relationship of Cricula with other species within the Saturniidae family.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».