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Enregistrement W4400951930 · doi:10.1016/j.mlwa.2024.100576

Supervised machine learning in drug discovery and development: Algorithms, applications, challenges, and prospects

2024· article· en· W4400951930 sur OpenAlexaff
George Obaido, Ibomoiye Domor Mienye, Oluwaseun Francis Egbelowo, Ikiomoye Douglas Emmanuel, Adeola Ogunleye, Blessing Ogbuokiri, Pere Mienye, Kehinde Aruleba

Notice bibliographique

RevueMachine Learning with Applications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDrug discoveryMachine learningComputer scienceArtificial intelligenceAlgorithmDrug developmentDevelopment (topology)DrugMathematicsBioinformaticsMedicineBiologyPharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Drug discovery and development is a time-consuming process that involves identifying, designing, and testing new drugs to address critical medical needs. In recent years, machine learning (ML) has played a vital role in technological advancements and has shown promising results in various drug discovery and development stages. ML can be categorized into supervised, unsupervised, semi-supervised, and reinforcement learning. Supervised learning is the most used category, helping organizations solve several real-world problems. This study presents a comprehensive survey of supervised learning algorithms in drug design and development, focusing on their learning process and succinct mathematical formulations, which are lacking in the literature. Additionally, the study discusses widely encountered challenges in applying supervised learning for drug discovery and potential solutions. This study will be beneficial to researchers and practitioners in the pharmaceutical industry as it provides a simplified yet comprehensive review of the main concepts, algorithms, challenges, and prospects in supervised learning. • Conducted a survey of supervised learning algorithms in drug design and development. • Provided mathematical formulations of these algorithms, addressing a gap in literature. • Identified challenges in applying supervised learning to drug discovery with solutions. • Presented algorithm concepts, challenges, and prospects, aiding researchers and practitioners.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,005
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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