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Enregistrement W4401011282 · doi:10.1101/2024.07.25.605230

Competitive modulation of Kv1.2 gating by LMAN2 and Slc7a5

2024· preprint· en· W4401011282 sur OpenAlexaff
Damayantee Das, Shawn M. Lamothe, Anson Wong, Victoria A. Baronas, Harley T. Kurata

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGatingRegulatorPotassium channelCell biologyDepolarizationChemistryBiophysicsBiologyNeuroscienceBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Kv1.2 is a prominent ion channel in the CNS, where it regulates neuronal excitability. Kv1.2 structure and function are well understood, but there is less consensus on mechanisms of regulation of Kv1.2 and other potassium channels by auxiliary proteins. We identified novel regulators of Kv1.2 by a mass spectrometry approach. The neutral amino acid transporter Slc7a5 causes a dramatic hyperpolarizing shift of channel activation. In contrast, LMAN2 is a recently identified candidate regulator that has the opposite effect on gating: large depolarizing voltages are required to activate Kv1.2 channels co-expressed with LMAN2. In this study, we characterized the functional interaction between LMAN2 and Slc7a5 on Kv1.2 gating properties and identified key structural elements that underlie sensitivity to each regulator. When LMAN2 and Slc7a5 are expressed together, Kv1.2 activation exhibits a bi-modal voltage-dependence, suggesting two distinct populations of channels regulated either by LMAN2 or Slc7a5, but not both. Using a Kv1.2:1.5 chimeric approach, we identified specific regions between the S1 to S3 segments of the voltage sensing domain (VSD) that are distinct for either Slc7a5 or LMAN2 sensitivity. By replacing either segment with sequence from Kv1.5, modulation by the corresponding regulator was selectively abolished. These results suggest that Slc7a5 and LMAN2 compete for interaction with the Kv1.2 voltage sensor, leading to complex voltage-dependence of channel activity when both regulators are present in the cell.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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