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Enregistrement W4401015444 · doi:10.1016/j.envint.2024.108907

DNA damage and its association with early-life exposome: Gene-environment analysis in Colombian children under five years old

2024· article· en· W4401015444 sur OpenAlexfundno aff
Diana Marín, Diana M. Narváez, Anamaría Sierra, Juan Sebastián Molina, I. Ortiz, J.J. Builes, Olga Morales, Martha Cuellar, Andrea Corredor, Milena Villamil‐Osorio, María Alejandra Bejarano, Dolly Vidal, Xavier Basagaña, Augusto Anguita‐Ruiz, Léa Maître, Alan Domínguez, Ana Valencia, Julián Henao, José Miguel Abad, Verónica Lopera, Ferney Amaya-Fernández, Luis Miguel Aristizábal, Laura Andrea Rodríguez-Villamizar, Carlos Ramos-Contreras, Lucelly López, Luis Jorge Hernández Flórez, Shrikant I. Bangdiwala, Helena Groot, Zulma Vanessa Rueda

Notice bibliographique

RevueEnvironment International · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueHealth, Environment, Cognitive Aging
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Science and Technology, CroatiaCanada Research ChairsCanada Excellence Research Chairs, Government of CanadaMinisterio de Ciencia, Tecnología e Innovación
Mots-clésExposomeDNA damageBiologyEnvironmental healthMedicineGeneticsDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Environmental exposures and gene-exposure interactions are the major causes of some diseases. Early-life exposome studies are needed to elucidate the role of environmental exposures and their complex interactions with biological mechanisms involved in childhood health. This study aimed to determine the contribution of early-life exposome to DNA damage and the modifying effect of genetic polymorphisms involved in air pollutants metabolism, antioxidant defense, and DNA repair. We conducted a cohort study in 416 Colombian children under five years. Blood samples at baseline were collected to measure DNA damage by the Comet assay and to determine GSTT1, GSTM1, CYP1A1, H2AX, OGG1, and SOD2 genetic polymorphisms. The exposome was estimated using geographic information systems, remote sensing, LUR models, and questionnaires. The association exposome-DNA damage was estimated using the Elastic Net linear regression with log link. Our results suggest that exposure to PM2.5 one year before the blood draw (BBD) (0.83, 95 %CI: 0.76; 0.91), soft drinks consumption (0.94, 0.89; 0.98), and GSTM1 null genotype (0.05, 0.01; 0.36) diminished the DNA damage, whereas exposure to PM2.5 one-week BBD (1.18, 1.06; 1.32), NO2 lag-5 days BBD (1.27, 1.18; 1.36), in-house cockroaches (1.10, 1.00; 1.21) at the recruitment, crowding at home (1.34, 1.08; 1.67) at the recruitment, cereal consumption (1.11, 1.04; 1.19) and H2AX (AG/GG vs. AA) (1.44, 1.11; 1.88) increased the DNA damage. The interactions between H2AX (AG/GG vs. AA) genotypes with crowding and PM2.5 one week BBD, GSTM1 (null vs. present) with humidity at the first year of life, and OGG1 (SC/CC vs. SS) with walkability at the first year of life were significant. The early-life exposome contributes to elucidating the effect of environmental exposures on DNA damage in Colombian children under five years old. The exposome-DNA damage effect appears to be modulated by genetic variants in DNA repair and antioxidant defense enzymes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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