MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4401051557 · doi:10.1038/s41467-024-49950-2

A CCG expansion in ABCD3 causes oculopharyngodistal myopathy in individuals of European ancestry

2024· article· en· W4401051557 sur OpenAlexaff
Andrea Cortese, Sarah J. Beecroft, Stefano Facchini, Riccardo Curró, Macarena Cabrera‐Serrano, Igor Stevanovski, Sanjog R. Chintalaphani, Hasindu Gamaarachchi, Ben Weisburd, Chiara Folland, Gavin Monahan, Carolin K. Scriba, Lein Dofash, Mridul Johari, Bianca R. Grosz, Melina Ellis, Liam G. Fearnley, Rick M. Tankard, Justin Read, Ashirwad Merve, Natalia Dominik, Elisa Vegezzi, Ricardo Parolin Schnekenberg, Gorka Fernández‐Eulate, Marion Masingue, Diane Giovannini, Martin B. Delatycki, Elsdon Storey, M.D. Gardner, David J. Amor, Garth A. Nicholson, Steve Vucic, Robert D. Henderson, Thomas Robertson, Jason Dyke, Vicki Fabian, Frank Mastaglia, Mark R. Davis, Marina Kennerson, Piraye Oflazer, Nazlı Başak, Hülya Kayserili, Gözde Yeşil, Edoardo Malfatti, James B Lilleker, Matthew Wicklund, Robert D. S. Pitceathly, Stefen Brady, Bernard Brais, David Pellerin, Stephan Züchner, Matt C. Danzi, Marina Grandis, Giacomo P. Comi, Stefania Corti, Elena Abati, Antonio Toscano, Arianna Manini, Arianna Ghia, Cristina Tassorelli, Ilaria Quartesan, Roberto Simone, Alexander M. Rossor, Mary M. Reilly, Liam Carroll, Volker Straub, Bjarne Udd, Zhiyong Chen, Gisèle Bonne, Rosaline C. M. Quinlivan, Simon Hammans, Arianna Tucci, Melanie Bahlo, Catriona McLean, Nigel G. Laing, Tanya Stojkovic, Henry Houlden, Michael G. Hanna, Ira W. Deveson, Paul J. Lockhart, Phillipa J. Lamont, Michael Fahey, Enrico Bugiardini, Gianina Ravenscroft

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFondazione Regionale per la Ricerca BiomedicaNational Institute for Health and Care ResearchAustralian Cancer Research FoundationAustralian GovernmentMinistero della SaluteRegione LombardiaDepartment of Health and Social CareGovernment of Western AustraliaFondazione CariploNational Health and Medical Research CouncilCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésMyopathyMuscle biopsyTrinucleotide repeat expansionBiologyDysphagiaPathologyGeneticsAnatomyMedicineBiopsyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oculopharyngodistal myopathy (OPDM) is an inherited myopathy manifesting with ptosis, dysphagia and distal weakness. Pathologically it is characterised by rimmed vacuoles and intranuclear inclusions on muscle biopsy. In recent years CGG • CCG repeat expansion in four different genes were identified in OPDM individuals in Asian populations. None of these have been found in affected individuals of non-Asian ancestry. In this study we describe the identification of CCG expansions in ABCD3, ranging from 118 to 694 repeats, in 35 affected individuals across eight unrelated OPDM families of European ancestry. ABCD3 transcript appears upregulated in fibroblasts and skeletal muscle from OPDM individuals, suggesting a potential role of over-expression of CCG repeat containing ABCD3 transcript in progressive skeletal muscle degeneration. The study provides further evidence of the role of non-coding repeat expansions in unsolved neuromuscular diseases and strengthens the association between the CGG • CCG repeat motif and a specific pattern of muscle weakness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature CommunicationsMême sujetGenetic Neurodegenerative DiseasesTravaux en français237 207