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Enregistrement W4401076320 · doi:10.1111/pim.13058

Mass Spectrometry Identifies <i>Taenia solium</i> Proteins in Sera of Patients With and Without Parenchymal Neurocysticercosis

2024· article· en· W4401076320 sur OpenAlexaff
Betcy Evangeline Pamela, Chhaya Patole, Subashini Thamizhmaran, Ranjith K. Moorthy, Josephin Manoj, Anupriya Thanigachalam, James R. Hocker, Douglas A. Drevets, Anu Mary Oommen, Vedantam Rajshekhar, Hélène Carabin, V. Prabhakaran

Notice bibliographique

RevueParasite Immunology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParasitic infections in humans and animals
Établissements canadiensUniversité de MontréalCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUniversity of Oklahoma Health Sciences CenterUniversity of Oklahoma
Mots-clésNeurocysticercosisTaenia soliumParenchymaBiologyTaeniaTaeniasisCysticercosisHelminthiasisImmunologyCestode infectionsParasite hostingPathologyHelminthsZoologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neurocysticercosis (NCC), a major cause of global acquired epilepsy, results from Taenia solium larval brain infection. T. solium adult worms release large numbers of infective eggs into the environment contributing to high levels of exposure in endemic areas. This study identifies T. solium proteins in the sera of individuals with and without NCC using mass spectrometry to examine exposure in endemic regions. Forty-seven patients (18-51 years), 24 parenchymal NCC (pNCC), 8 epilepsy of unknown aetiology, 7 glioma, 8 brain tuberculoma, and 7 healthy volunteers were studied. Trypsin digested sera were subject to liquid chromatography-tandem mass spectrometry and spectra of 375-1700 m/z matched against T. solium WormBase ParaSite database with MaxQuant software to identify T. solium proteins. Three hundred and nineteen T. solium proteins were identified in 87.5% of pNCC and 56.6% of non-NCC subjects. Three hundred and four proteins were exclusive to pNCC sera, seven to non-NCC sera and eight in both. Ten percent, exhibiting immune-modulatory properties, originated from the oncosphere and cyst vesicular fluid. In conclusion, in endemic regions, T. solium proteins are detected in sera of individuals with and without pNCC. The immunomodulatory nature of these proteins may influence susceptibility and course of infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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