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Enregistrement W4401110150 · doi:10.69998/j2br1

Antiviral Activities of Compounds Derived from Medicinal Plants against SARS-CoV-2 Based on Molecular Docking of Proteases

2024· article· en· W4401110150 sur OpenAlexafffund
Mohamed Chebaibi, Ibrahim Mssillou, Aimad Allali, Mohammed Bourhia, Dalila Bousta, Rene Gonçalves, Hasnae Hoummani, Mourad A. M. Aboul‐Soud, Maria Augustyniak, John P. Giesy, Sanae Achour

Notice bibliographique

RevueJournal of Biology and Biomedical Research. /$c Fatima Zohra Rezouki · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueEssential Oils and Antimicrobial Activity
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsBaylor University
Mots-clésProteasesChemistryDocking (animal)ProteasePhytochemicalOrganosulfur compoundsBiochemistryPolyphenolEnzymeStereochemistryAntioxidantOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This work aimed to evaluate the inhibitory effect of the main polyphenols and flavonoids of Syzygium aromaticum and Citrus limon as well as the main organosulfur compounds of Allium sativum against SARS-CoV-2 6LU7 and 6Y2E proteases using in silico molecular docking analysis. Structures of 34 natural products found in three medicinal plants were docked to these two critical proteins. For 6LU7 protease, 24 compounds exhibited binding affinities greater than or equal to -6 Kcal/mol. While, for 6Y2E protease, 6 compounds exhibited binding affinities greater than or equal to -6 Kcal/mol. Molecules with a maximum binding affinity equal to -8.4 kcal/mol show good hydrogen bonds with the two proteases under investigation, 6LU7 and 6Y2E. Diosmin, ellagic acid, narirutin, neoeriocitrin, and neohesperidin were suggested as inhibitors of SARS-COV-2. These compounds might be used therapeutically as complementary medicines and/or to conceptualize new drugs against COVID-19.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,499

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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