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Enregistrement W4401121038 · doi:10.1093/mnras/stae1837

Adapting <scp>arepo-rt</scp> for exascale computing: GPU acceleration and efficient communication

2024· article· en· W4401121038 sur OpenAlexafffund
Oliver Zier, Rahul Kannan, Aaron Smith, Mark Vogelsberger, Erkin Verbeek

Notice bibliographique

RevueMonthly Notices of the Royal Astronomical Society · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueOpportunistic and Delay-Tolerant Networks
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Aeronautics and Space AdministrationNational Science Foundation
Mots-clésExascale computingPetascale computingScalabilitySpeedupPortingComputer scienceParallel computingSupercomputerPhysicsContext (archaeology)Node (physics)Computational scienceSoftwareOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Radiative transfer (RT) is a crucial ingredient for self-consistent modelling of numerous astrophysical phenomena across cosmic history. However, on-the-fly integration into radiation hydrodynamics (RHD) simulations is computationally demanding, particularly due to the stringent time-stepping conditions and increased dimensionality inherent in multifrequency collisionless Boltzmann physics. The emergence of exascale supercomputers, equipped with extensive CPU cores and GPU accelerators, offers new opportunities for enhancing RHD simulations. We present the first steps towards optimizing arepo-rt for such high-performance computing environments. We implement a novel node-to-node (n-to-n) communication strategy that utilizes shared memory to substitute intranode communication with direct memory access. Furthermore, combining multiple internode messages into a single message substantially enhances network bandwidth utilization and performance for large-scale simulations on modern supercomputers. The single-message n-to-n approach also improves performance on smaller scale machines with less optimized networks. Furthermore, by transitioning all RT-related calculations to GPUs, we achieve a significant computational speedup of around 15 for standard benchmarks compared to the original CPU implementation. As a case study, we perform cosmological RHD simulations of the Epoch of Reionization, employing a similar setup as the THESAN project. In this context, RT becomes sub-dominant such that even without modifying the core arepo codebase, there is an overall threefold improvement in efficiency. The advancements presented here have broad implications, potentially transforming the complexity and scalability of future simulations for a wide variety of astrophysical studies. Our work serves as a blueprint for porting similar simulation codes based on unstructured resolution elements to GPU-centric architectures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,298
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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