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Enregistrement W4401174233 · doi:10.3390/metabo14080421

Factors Affecting Non-Enzymatic Protein Acylation by trans-3-Methylglutaconyl Coenzyme A

2024· article· en· W4401174233 sur OpenAlexaff
Elizabeth A. Jennings, Megan M. Macdonald, Irina Romenskaia, Hao Yang, Grant A. Mitchell, Robert O. Ryan

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésEnzymeBovine serum albuminBiochemistryMetaboliteCatabolismChemistryCoenzyme ALeucineAcylationAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The leucine catabolism pathway intermediate, trans-3-methylglutaconyl (3MGC) CoA, is considered to be the precursor of 3MGC acid, a urinary organic acid associated with specific inborn errors of metabolism (IEM). trans-3MGC CoA is an unstable molecule that can undergo a sequence of non-enzymatic chemical reactions that lead to either 3MGC acid or protein 3MGCylation. Herein, the susceptibility of trans-3MGC CoA to protein 3MGCylation was investigated. trans-3MGC CoA was generated through the activity of recombinant 3-methylcrotonyl CoA carboxylase (3MCCCase). Following enzyme incubations, reaction mixtures were spin-filtered to remove 3MCCCase. The recovered filtrates, containing trans-3MGC CoA, were then incubated in the presence of bovine serum albumin (BSA). Following this, sample aliquots were subjected to α-3MGC IgG immunoblot analysis to probe for 3MGCylated BSA. Experiments revealed a positive correlation between trans-3MGC CoA incubation temperature and 3MGCylated BSA immunoblot signal intensity. A similar correlation was observed between incubation time and 3MGCylated BSA immunoblot signal intensity. When trans-3MGC CoA hydratase (AUH) was included in incubations containing trans-3MGC CoA and BSA, 3MGCylated BSA immunoblot signal intensity decreased. Evidence that protein 3MGCylation occurs in vivo was obtained in studies with liver-specific 3-hydroxy-3-methylglutaryl (HMG) CoA lyase knockout mice. Therefore, trans-3MGC CoA is a reactive, potentially toxic metabolite, and under normal physiological conditions, lowering trans-3MGC CoA levels via AUH-mediated hydration to HMG CoA protects against aberrant non-enzymatic chemical reactions that lead to protein 3MGCylation and 3MGC acid production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,170
Score d'incertitude au seuil0,945

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
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Résumé présentoui

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