MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4401200850 · doi:10.1093/brain/awae185

Biallelic null variants in <i>PNPLA8</i> cause microcephaly by reducing the number of basal radial glia

2024· article· en· W4401200850 sur OpenAlexfundno aff
Y. Nakamura, Issei S. Shimada, Reza Maroofian, Micol Falabella, Maha S. Zaki, Masanori Fujimoto, Emi Sato, Hiroshi Takase, Shiho Aoki, Akihiko Miyauchi, Eriko Koshimizu, Satoko Miyatake, Yuko Arioka, Mizuki Honda, Takayoshi Higashi, Fuyuki Miya, Yukimune Okubo, I. Ogawa, Annarita Scardamaglia, Mohammad Miryounesi, Sahar Alijanpour, Farzad Ahmadabadi, Peter Herkenrath, Hormos Salimi Dafsari, Clara Velmans, Mohammed Al Balwi, Antonio Vitobello, Anne‐Sophie Denommé‐Pichon, Médéric Jeanne, Antoine Civit, Mohamed S. Abdel‐Hamid, Hamed Naderi, Hossein Darvish, Somayeh Bakhtiari, Michael C. Kruer, Christopher J. Carroll, Ehsan Ghayoor Karimiani, Rozhgar A. Khailany, Talib Adil Abdulqadir, Mehmet Özaslan, Peter Bauer, Giovanni Zifarelli, Tahere Seifi, Mina Zamani, Chadi Al Alam, Javeria Raza Alvi, Tipu Sultan, Stéphanie Efthymiou, Simon Pope, Kazuhiro Haginoya, Tamihide Matsunaga, Hitoshi Osaka, Naomichi Matsumoto, Norio Ozaki, Yasuyuki Ohkawa, Shinya Oki, Tatsuhiko Tsunoda, Robert D. S. Pitceathly, Yoshitaka Taketomi, Henry Houlden, Makoto Murakami, Yoichi Kato, Shinji Saitoh

Notice bibliographique

RevueBrain · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeOno Medical Research FoundationMedical Research CouncilCURE Childhood Cancer AssociationDaiko FoundationMedical Research Council CanadaLifeArcNagoya City UniversityDeutsche ForschungsgemeinschaftKawano Masanori Memorial Public Interest Incorporated FoundationJapan Agency for Medical Research and DevelopmentUniversität zu KölnRosetrees TrustJapan Society for the Promotion of ScienceMuscular Dystrophy UKMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyNational Center for Child Health and Development
Mots-clésBiologyLysophosphatidic acidMicrocephalyNeurodegenerationNeural stem cellCell biologyPhenotypeInduced pluripotent stem cellGeneticsPathologyStem cellEmbryonic stem cellMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Patatin-like phospholipase domain-containing lipase 8 (PNPLA8), one of the calcium-independent phospholipase A2 enzymes, is involved in various physiological processes through the maintenance of membrane phospholipids. Biallelic variants in PNPLA8 have been associated with a range of paediatric neurodegenerative disorders. However, the phenotypic spectrum, genotype-phenotype correlations and the underlying mechanisms are poorly understood. Here, we newly identified 14 individuals from 12 unrelated families with biallelic ultra-rare variants in PNPLA8 presenting with a wide phenotypic spectrum of clinical features. Analysis of the clinical features of current and previously reported individuals (25 affected individuals across 20 families) showed that PNPLA8-related neurological diseases manifest as a continuum ranging from variable developmental and/or degenerative epileptic-dyskinetic encephalopathy to childhood-onset neurodegeneration. We found that complete loss of PNPLA8 was associated with the more profound end of the spectrum, with congenital microcephaly. Using cerebral organoids generated from human induced pluripotent stem cells, we found that loss of PNPLA8 led to developmental defects by reducing the number of basal radial glial cells and upper-layer neurons. Spatial transcriptomics revealed that loss of PNPLA8 altered the fate specification of apical radial glial cells, as reflected by the enrichment of gene sets related to the cell cycle, basal radial glial cells and neural differentiation. Neural progenitor cells lacking PNPLA8 showed a reduced amount of lysophosphatidic acid, lysophosphatidylethanolamine and phosphatidic acid. The reduced number of basal radial glial cells in patient-derived cerebral organoids was rescued, in part, by the addition of lysophosphatidic acid. Our data suggest that PNPLA8 is crucial to meet phospholipid synthetic needs and to produce abundant basal radial glial cells in human brain development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,494
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBrainMême sujetMitochondrial Function and PathologyTravaux en français237 207