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Enregistrement W4401209372 · doi:10.3390/biom14080932

The RNA Demethylases ALKBH5 and FTO Regulate the Translation of ATF4 mRNA in Sorafenib-Treated Hepatocarcinoma Cells

2024· article· en· W4401209372 sur OpenAlexafffund
Pauline Adjibade, Sergio Di Marco, Imed‐Eddine Gallouzi, Rachid Mazrouï

Notice bibliographique

RevueBiomolecules · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaKing Abdullah University of Science and TechnologyCancer Research SocietyUniversité Laval
Mots-clésATF4BiologyMessenger RNATranslation (biology)Gene knockdownP-bodiesTranslational regulationTranslational efficiencyMolecular biologyProtein biosynthesisCell biologyUnfolded protein responseGeneBiochemistryEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Translation is one of the main gene expression steps targeted by cellular stress, commonly referred to as translational stress, which includes treatment with anticancer drugs. While translational stress blocks the translation initiation of bulk mRNAs, it nonetheless activates the translation of specific mRNAs known as short upstream open reading frames (uORFs)-mRNAs. Among these, the ATF4 mRNA encodes a transcription factor that reprograms gene expression in cells responding to various stresses. Although the stress-induced translation of the ATF4 mRNA relies on the presence of uORFs (upstream to the main ATF4 ORF), the mechanisms mediating this effect, particularly during chemoresistance, remain elusive. Here, we report that ALKBH5 (AlkB Homolog 5) and FTO (FTO: Fat mass and obesity-associated protein), the two RNA demethylating enzymes, promote the translation of ATF4 mRNA in a transformed liver cell line (Hep3B) treated with the chemotherapeutic drug sorafenib. Using the in vitro luciferase reporter translational assay, we found that depletion of both enzymes reduced the translation of the reporter ATF4 mRNA upon drug treatment. Consistently, depletion of either protein abrogates the loading of the ATF3 mRNA into translating ribosomes as assessed by polyribosome assays coupled to RT-qPCR. Collectively, these results indicate that the ALKBH5 and FTO-mediated translation of the ATF4 mRNA is regulated at its initiation step. Using in vitro methylation assays, we found that ALKBH5 is required for the inhibition of the methylation of a reporter ATF4 mRNA at a conserved adenosine (A235) site located at its uORF2, suggesting that ALKBH5-mediated translation of ATF4 mRNA involves demethylation of its A235. Preventing methylation of A235 by introducing an A/G mutation into an ATF4 mRNA reporter renders its translation insensitive to ALKBH5 depletion, supporting the role of ALKBH5 demethylation activity in translation. Finally, targeting either ALKBH5 or FTO sensitizes Hep3B to sorafenib-induced cell death, contributing to their resistance. In summary, our data show that ALKBH5 and FTO are novel factors that promote resistance to sorafenib treatment, in part by mediating the translation of ATF4 mRNA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,234

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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