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Enregistrement W4401211208 · doi:10.1126/science.ado1663

Convergent evolution of plant prickles by repeated gene co-option over deep time

2024· article· en· W4401211208 sur OpenAlexaff
James Satterlee, David Alonso, Pietro Gramazio, Katharine M. Jenike, Jia He, Andrea Arrones, Gloria Villanueva, Mariola Plazas, Srividya Ramakrishnan, Matthias Benoit, Iacopo Gentile, Anat Hendelman, Hagai Shohat, B. P. Fitzgerald, Gina M. Robitaille, Yumi Green, Kerry Swartwood, Michael J. Passalacqua, Edeline Gagnon, Rebecca Hilgenhof, Trevis D. Huggins, Georgia C. Eizenga, Amit Gur, Twan Rutten, Nils Stein, Shengrui Yao, Adrien Poncet, Clément Bellot, Amy Frary, Sandra Knapp, Mohammed Bendahmane, Tiina Särkinen, Jesse Gillis, Joyce Van Eck, Michael C. Schatz, Yuval Eshed, Jaime Prohens, Santiago Vilanova, Zachary B. Lippman

Notice bibliographique

RevueScience · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueCocoa and Sweet Potato Agronomy
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesConselleria de Innovación, Universidades, Ciencia y Sociedad Digital, Generalitat ValencianaAgencia Estatal de InvestigaciónNational Institutes of HealthDirectorate for Biological SciencesEuropean CommissionEuropean Regional Development FundNational Institute of Mental HealthGeneralitat ValencianaDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Social FundInstitut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'EnvironnementMinisterio de Ciencia, Innovación y UniversidadesHoward Hughes Medical InstituteNational Geographic SocietyNational Science Foundation
Mots-clésConvergent evolutionBiologyEvolutionary biologyParallel evolutionTraitPlant evolutionGeneCytokininGenusMutationPhylogeneticsEcologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An enduring question in evolutionary biology concerns the degree to which episodes of convergent trait evolution depend on the same genetic programs, particularly over long timescales. In this work, we genetically dissected repeated origins and losses of prickles—sharp epidermal projections—that convergently evolved in numerous plant lineages. Mutations in a cytokinin hormone biosynthetic gene caused at least 16 independent losses of prickles in eggplants and wild relatives in the genus Solanum . Homologs underlie prickle formation across angiosperms that collectively diverged more than 150 million years ago, including rice and roses. By developing new Solanum genetic systems, we leveraged this discovery to eliminate prickles in a wild species and an indigenously foraged berry. Our findings implicate a shared hormone activation genetic program underlying evolutionarily widespread and recurrent instances of plant morphological innovation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,591
Score d'incertitude au seuil0,594

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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