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Enregistrement W4401258442 · doi:10.1186/s13071-024-06413-3

Bartonella quintana detection among arthropods and their hosts: a systematic review and meta-analysis

2024· review· en· W4401258442 sur OpenAlexafffund
Carl Boodman, Nitin Gupta, Johan van Griensven, Wim Van Bortel

Notice bibliographique

RevueParasites & Vectors · 2024
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBartonella species infections research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchVlaamse regeringFonds Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésBiologyParasitologyMeta-analysisMedical microbiologyVeterinary medicineZoologyInternal medicineMicrobiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Bartonella quintana is a body louse-borne bacterium causing bacteremia and infective endocarditis. We aimed to describe B. quintana detection among arthropods and their hosts. METHODS: We searched databases in PubMed Central/MEDLINE, Scopus, Embase, and Web of Science from January 1, 1915 (the year of B. quintana discovery) to January 1, 2024, to identify publications containing specific search terms relating to B. quintana detection among arthropods. Descriptive statistics and meta-analysis of pooled prevalence using random-effects models were performed for all arthropods and body and head lice. RESULTS: Of 1265 records, 62 articles were included, describing 8839 body lice, 4962 head lice, and 1692 other arthropods, such as different species of fleas, bedbugs, mites, and ticks. Arthropods were collected from 37 countries, of which 28 had arthropods with B. quintana DNA. Among articles that reported B. quintana detection among individual arthropods, 1445 of 14,088 (0.1026, 95% CI [0.0976; 0.1077]) arthropods tested positive for B. quintana DNA, generating a random-effects model global prevalence of 0.0666 (95% CI [0.0426; 0.1026]). Fifty-six studies tested 8839 body lice, of which 1679 had B. quintana DNA (0.1899, 95% CI [0.1818; 0.1983]), generating a random-effects model pooled prevalence of 0.2312 (95% CI [0.1784; 0.2843]). Forty-two studies tested 4962 head lice, of which 390 head lice from 20 studies originating from 11 different countries had B. quintana DNA (0.0786, 95% CI [0.0713; 0.0864]). Eight studies detected B. quintana DNA exclusively on head lice. Five studies reported greater B. quintana detection on head lice than body lice; all originated from low-resource environments. CONCLUSIONS: Bartonella quintana is a vector-borne bacterium with a global distribution, disproportionately affecting marginalized populations. Bartonella quintana DNA has been detected in many different arthropod species, though not all of these arthropods meet criteria to be considered vectors for B. quintana transmission. Body lice have long been known to transmit B. quintana. A limited number of studies suggest that head lice may also act as possible vectors for B. quintana in specific low-resource contexts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0110,022
Bibliométrie0,0090,009
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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