Absence of a functional gut microbiome impairs host amino acid metabolism in the Pacific spiny dogfish (<i>Squalus suckleyi</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Nitrogen recycling and amino acid synthesis are two notable ways in which the gut microbiome can contribute to host metabolism, and these processes are especially important in nitrogen-limited animals. Marine elasmobranchs are nitrogen limited as they require substantial amounts of this element to support urea-based osmoregulation. However, following antibiotic-induced depletion of the gut microbiome, elasmobranchs are known to experience a significant decline in circulating urea and employ compensatory nitrogen conservation strategies such as reduced urea and ammonia excretion. We hypothesized that the elasmobranch gut microbiome transforms dietary and recycled nutrients into amino acids, supporting host carbon and nitrogen balance. Here, using stable isotope analyses, we found that depleting the gut microbiome of Pacific spiny dogfish (Squalus suckleyi) resulted in a significant reduction to the incorporation of supplemented dietary 15N into plasma amino acids, notably those linked to nitrogen handling and energy metabolism, but had no effect on gut amino acid transport. These results demonstrate the importance of gut microbes to host amino acid pools and the unique nitrogen handling strategy of marine elasmobranchs. More broadly, these results elucidate how the gut microbiome contributes to organismal homeostasis, which is likely a ubiquitous phenomenon across animal populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».