Ascertainment of uninterrupted CAG repeat length and disease-modifying variants in fragment-based genetic testing for Huntington Disease
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Purpose In Huntington disease (HD), synonymous variants causing loss or duplication of the interrupting CAA codon in the HTT CAG repeat modify disease onset. These variants are undetectable during HD genetic testing, resulting in inaccurate diagnostic reporting of uninterrupted CAG repeat length. Inaccurate reporting of CAG repeat length results in misdiagnosis of individuals with alleles near diagnostic cut-offs. We present a method to identify variant alleles during CAG repeat genotyping, allowing accurate diagnostic reporting of uninterrupted CAG repeat length. Methods We used triplet-primed PCR (TP-PCR) to amplify HTT CAG repeat alleles with canonical or noncanonical repeat interruptions and leveraged differences in peak amplification patterns to develop a screening method based on peak height ratio (PHR). We used PHR to screen blood DNA from a cohort of symptomatic individuals with diagnostic CAG repeat lengths of 40 to 41. Results TP-PCR enables accurate reporting of uninterrupted CAG repeat length in diagnostic testing by detecting HD alleles with loss or duplication of the CAG repeat interruption. Conclusion PHR screening of TP-PCR traces is a cost-effective screening method for detection, ascertainment of uninterrupted HTT CAG repeat length, and accurate diagnostic reporting for individuals with disease-modifying noncanonical CAG repeat interruptions.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle