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Enregistrement W4401274290 · doi:10.1158/2159-8290.26466973.v1

Supplementary Figures S1-S10 from ZNF397 Deficiency Triggers TET2-Driven Lineage Plasticity and AR-Targeted Therapy Resistance in Prostate Cancer

2024· preprint· en· W4401274290 sur OpenAlexaff
Yaru Xu, Yuqiu Yang, Zhaoning Wang, Martin Sjöström, Yuyin Jiang, Yitao Tang, Siyuan Cheng, Su Deng, Choushi Wang, Julisa Gonzalez, Nickolas A. Johnson, Xiang Li, Xiaoling Li, Lauren A. Metang, Atreyi Mukherji, Quanhui Xu, Carla R. Tirado, Garrett Wainwright, Xinzhe Yu, Spencer Barnes, Mia Hofstad, Yu Chen, Hong Zhu, Ariella B. Hanker, Ganesh V. Raj, Guanghui Zhu, Housheng Hansen He, Zhao Wang, Carlos L. Arteaga, Han Liang, Felix Y. Feng, Yunguan Wang, Tao Wang, Ping Mu

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpigeneticsCancer researchGeneProstate cancerBiologyGeneticsCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Figure S1. ZNF397-deficiency has bifurcated effects on PCa with or without AR inhibition. Figure S2. The impact of ZNF397-deficiency on AR protein and AR cistrome. Figure S3. ZNF397 is required for the activation of canonical AR transcriptional program. Figure S4. ZNF397-KO impairs DHT-induced AR signaling activation. Figure S5. ZNF397-KO promotes multilineage and lineage plastic gene expression. Figure S6. ZNF397-KO promotes stem-like and EMT-like transcriptional programs. Figure S7. ZNF397-KO led to induction of TET2 downstream genes. Figure S8. ZNF397-KO promotes transcriptional activation of TET2 downstream genes. Figure S9. ZNF397-deficiency has bifurcated effects on AR-dependent vs AR-independent PCas. Figure S10. Targeting TET2-driven epigenetic rewiring to overcome resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,719
Score d'incertitude au seuil0,401

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,7190,205

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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