NVTG-03 IDENTIFYING THE DRIVERS OF EARLY BRAIN METASTASES ESTABLISHMENT IN BREAST CANCER PATIENTS
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Breast cancer is the most common type of cancer in women. It is also the 2nd most common cause of brain metastases (BrM), with 30-50% of breast cancer patients developing BrM over the course of their disease. Despite aggressive therapy and novel systemic treatment options, prognosis for these patients remains poor. The objectives of our work were to identify the underlying genomic and transcriptomic signatures that characterise early BrM establishment in patients with breast cancer, and to identify brain-intrinsic molecular mechanisms critical to BrM development. We performed transcriptomic and genomic profiling on fresh frozen (FF) brain metastases tumour samples of patients who required surgical resection of an intracranial metastatic early (<3 years from initial diagnosis) or late (>3 years from initial diagnosis) in the disease course. Findings were validated by immunohistochemistry and immunofluorescence staining for genes of interest in BrM, matched primary breast tumour samples, and healthy brain tissue. The findings were complemented with scRNA sequencing studies to resolve cellular contributions of individual cell types and subtypes and uncover specific cell-type interactions in BrM establishment. In patients with early metastatic disease, pathway enrichment analysis identified TGF-β pathway upregulation, which stimulates epithelial-to-mesenchymal transition, integrin-mediated invasion, recruitment and activation of cancer-associated fibroblasts. We identified collagen-extracellular matrix interactions as key oncogenic features of the metastatic tumour microenvironment. We have selected lead candidates that can play significant role in early colonisation of breast cancer cells to the brain from the primary breast tumour and enhance tumorigenesis. These markers will be challenged in an in vivo brain metastasis model to attenuate the establishment of metastatic disease. Our goal is to identify a modifiable marker that could be clinically targeted to prevent the establishment of brain metastases in patients diagnosed with breast cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».