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Enregistrement W4401305040 · doi:10.1093/noajnl/vdae090.069

NIRL-08 AUTOMATED LONGITUDINAL TRACKING OF BRAIN METASTASES INTEGRATED IN A USER-ORIENTED SOFTWARE

2024· article· en· W4401305040 sur OpenAlexaff
Ramón D. Emiliani, Gabriel Chartrand, Sophie Anne Pawlowski, S. Rajakesari, Alexandre Cengarle-Samak, Jeremi Lavoie, Simon Ducharme, David Roberge

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology Advances · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University InstituteCentre Hospitalier de l’Université de MontréalHôpital Charles-Le Moyne
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSegmentationCentroidComputer scienceArtificial intelligencePattern recognition (psychology)Matching (statistics)Similarity (geometry)Tracking (education)Sørensen–Dice coefficientSoftwareComputer visionImage segmentationImage (mathematics)MedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The burden of detection and segmentation of brain metastases (BM) for treatment planning and response assessment has been found to be alleviated by machine learning methods. However, tracking individual lesions over time remains tedious and would benefit from automated assistance for complex cases. We developed a software solution combining an AI-based BM segmentation method with an automated pairing algorithm allowing to track BM across longitudinal scans. The proposed tracking method comprises two steps: identifying lesions in each scan and pairing identified findings across scans. Identification and segmentation of BM is done with our previously published neural network based algorithm. Tracking of BM is achieved by progressively assigning a lesion ID to individual findings. For each series, individual findings are co-registered using image registration to a reference series which defines the initial set of lesions. A matching function then computes a score for each possible finding-lesion pair based on diameter similarity and inter-centroid distance. Findings from highest scoring pairs are sequentially assigned their matched lesion ID, while pairs scoring under a given threshold are assigned a new lesion ID. Series are processed as such until all findings are dispatched. Assignment accuracy was assessed using adjusted rand index (ARI) on a synthetic noisy dataset simulating registration error and misdetections. Findings from 10 to 20 lesions on 5 series of dimension 100 mm per side were randomly generated for 100 synthetic patients each. With a simulated registration error range of 0-2 deg and 0-5mm, the average per patient ARI was 0.94 +/- 0.05, while an error range of 0-4 deg and 0-10mm lowered ARI to 0.87 +/-0.08. Results support the validity of our software solution for automated detection and longitudinal tracking of BM, which can alleviate the burden of follow-ups in the context of stereotactic radiosurgery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,814
Score d'incertitude au seuil0,724

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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