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Enregistrement W4401330485 · doi:10.3390/cancers16152761

The Performance and Clinical Applicability of HER2 Digital Image Analysis in Breast Cancer: A Systematic Review

2024· review· en· W4401330485 sur OpenAlexaff
Gauhar Dunenova, Zhanna Kalmataeva, Dilyara Kaidarova, Nurlan Dauletbaev, Yuliya Semenova, Мадина Мансурова, A M Grjibovski, Fatima Kassymbekova, Aidos Sarsembayev, Daniil Semenov, Natalya Glushkova

Notice bibliographique

RevueCancers · 2024
Typereview
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Health, University of SydneyAl-Farabi Kazakh National University
Mots-clésComputer scienceStandardizationReliability (semiconductor)Systematic reviewGround truthData miningInformation retrievalSet (abstract data type)Machine learningMedical physicsData scienceArtificial intelligenceMEDLINEMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This systematic review aims to address the research gap in the performance of computational algorithms for the digital image analysis of HER2 images in clinical settings. While numerous studies have explored various aspects of these algorithms, there is a lack of comprehensive evaluation regarding their effectiveness in real-world clinical applications. We conducted a search of the Web of Science and PubMed databases for studies published from 31 December 2013 to 30 June 2024, focusing on performance effectiveness and components such as dataset size, diversity and source, ground truth, annotation, and validation methods. The study was registered with PROSPERO (CRD42024525404). Key questions guiding this review include the following: How effective are current computational algorithms at detecting HER2 status in digital images? What are the common validation methods and dataset characteristics used in these studies? Is there standardization of algorithm evaluations of clinical applications that can improve the clinical utility and reliability of computational tools for HER2 detection in digital image analysis? We identified 6833 publications, with 25 meeting the inclusion criteria. The accuracy rate with clinical datasets varied from 84.19% to 97.9%. The highest accuracy was achieved on the publicly available Warwick dataset at 98.8% in synthesized datasets. Only 12% of studies used separate datasets for external validation; 64% of studies used a combination of accuracy, precision, recall, and F1 as a set of performance measures. Despite the high accuracy rates reported in these studies, there is a notable absence of direct evidence supporting their clinical application. To facilitate the integration of these technologies into clinical practice, there is an urgent need to address real-world challenges and overreliance on internal validation. Standardizing study designs on real clinical datasets can enhance the reliability and clinical applicability of computational algorithms in improving the detection of HER2 cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,017
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,117
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,092

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0170,117
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,008
Bibliométrie0,0100,010
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,360
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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