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Enregistrement W4401338273 · doi:10.1093/cei/uxae071

The immune landscape of the inflamed joint defined by spectral flow cytometry

2024· article· en· W4401338273 sur OpenAlexaff
Meryl H. Attrill, Diana Shinko, Vicky Alexiou, Melissa Kartawinata, Eslam Al‐Abadi, Kate Armon, Mariejennelynn Bostock, Katrin Buerkle, Charlotte Busby, M. Z. Butt, Chia-Ping Chou, Joanna Cobb, Louise Coke, Julie Cook, J. Mordaunt Crook, Serena Cruickshank-Hull, Karen Davies, Lucinda Dawson, Fatjon Dekaj, Julie Enright, Angela Etheridge, Elizabeth Fofana, Sophie Foxall, Paul Gilbert, Gunnar Gottschalk, E.G. Hahn, Daniel Hawley, Anne Hinks, Shashivadan P. Hirani, Ruth Howman, Fatema Jeraj, Emma Jordan, Laura Kassoumeri, Aline Kimonyo, Sham Lal, Alice Leahy, Freya Luling Feilding, I. D. Macdonald, Alyssia McNeece, Laura Melville, Halima Moncrieffe, Kathleen Mulligan, Stanton Newman, Fiona Patrick, Hannah Peckham, Elizabeth Ralph, Rachel Rikunenko, Emily Robinson, T. R. E. Southwood, Jason Sowter, Mujeeb Ullah, Wendy Thomson, Simona Ursu, Hemlata Varsani, Kishore Warrier, Lucy R. Wedderburn, Pamela Whitworth, Rachel Wiffen, Alexis Wormal, Meryl Atrill, Hameedah Dawoud, Beth Jebson, Şeyda Örs Kaya, Alka Patel, Anne M. Pesenacker, Chad Pils, Lizzy Rosser, Opuriche Tonye-Brown, Lucy R Wedderbur

Notice bibliographique

RevueClinical & Experimental Immunology · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilSwedish Orphan BiovitrumPfizerUniversity College London Hospitals NHS Foundation TrustGreat Ormond Street Institute of Child HealthNational Institute for Health and Care ResearchVersus ArthritisUK Research and Innovation
Mots-clésFlow cytometryJoint (building)Immune systemFlow (mathematics)BiologyImmunologyEngineeringPhysicsMechanics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cellular phenotype and function are altered in different microenvironments. For targeted therapies it is important to understand site-specific cellular adaptations. Juvenile idiopathic arthritis (JIA) is characterized by autoimmune joint inflammation, with frequent inadequate treatment responses. To comprehensively assess the inflammatory immune landscape, we designed a 37-parameter spectral flow cytometry panel delineating mononuclear cells from JIA synovial fluid (SF) of autoimmune inflamed joints, compared to JIA and healthy control blood. Synovial monocytes and NK cells (CD56bright) lack Fc-receptor CD16, suggesting antibody-mediated targeting may be ineffective. B cells and DCs, both in small frequencies in SF, undergo maturation with high 4-1BB, CD71, CD39 expression, supporting T-cell activation. SF effector and regulatory T cells were highly active with newly described co-receptor combinations that may alter function, and suggestion of metabolic reprogramming via CD71, TNFR2, and PD-1. Most SF effector phenotypes, as well as an identified CD4-Foxp3+ T-cell population, were restricted to the inflamed joint, yet specific SF-predominant CD4+ Foxp3+ Treg subpopulations were increased in blood of active but not inactive JIA, suggesting possible recirculation and loss of immunoregulation at distal sites. This first comprehensive dataset of the site-specific inflammatory landscape at protein level will inform functional studies and the development of targeted therapeutics to restore immunoregulatory balance and achieve remission in JIA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,349
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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