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Enregistrement W4401363298 · doi:10.1039/d4sc02915a

Probing the formation of a hetero-dimeric membrane transport complex with dual <i>in vitro</i> and <i>in silico</i> mutagenesis

2024· article· en· W4401363298 sur OpenAlexafffund
Nishadh Rathod, M. Joanne Lemieux, Christophe Chipot, Benoı̂t Roux, Howard S. Young

Notice bibliographique

RevueChemical Science · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchAlliance de recherche numérique du CanadaUniversity of WaterlooRoyal SocietyAgence Nationale de la RechercheNational Institutes of HealthRoyal Society of ChemistryNational Science Foundation
Mots-clésPhospholambanPentamerSERCATransmembrane proteinChemistryBiophysicsIn silicoMonomerMutagenesisTransmembrane domainMembraneBiochemistryBiologyMutantPhosphorylationATPaseReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

functional measurements of SERCA regulation by the PLN alanine substitutions. Initially, the changes in SERCA inhibition by PLN alanine substitutions were compared to the changes in free energy for the SERCA-PLN complex formed from the PLN monomer. However, the functional data for the PLN alanine substitutions were better explained by the formation of the SERCA-PLN complex directly from the PLN pentamer. This finding points to an inhibitory mechanism favoring conformational selection of SERCA and the interaction of a PLN pentamer with SERCA for 'delivery' of a PLN monomer to the inhibitory site. The implications of these findings suggest that the energetics of helix exchange between homo- and hetero-oligomeric signaling complexes is favored over an intermediate involving a free monomeric helix in the membrane bilayer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,197

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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